Decreased origin usage and initiation of DNA replication in haploinsufficient HCT116 Ku80+/- cells
Notice bibliographique
Résumé
One of the functions of the abundant heterodimeric nuclear protein, Ku (Ku70/Ku80), is its involvement in the initiation of DNA replication through its ability to bind to chromosomal replication origins in a sequence-specific and cell cycle dependent manner. Here, using HCT116 Ku80+/- cells, the effect of Ku80 deficiency on cell cycle progression and origin activation was examined. Western blot analyses revealed a 75% and 36% decrease in the nuclear expression of Ku80 and Ku70, respectively. This was concomitant with a 33% and 40% decrease in chromatin binding of both proteins, respectively. Cell cycle analysis of asynchronous and late G1 synchronized Ku80+/- cells revealed a prolonged G1 phase. Furthermore, these Ku-deficient cells had a 4.5-, 3.4- and 4.3-fold decrease in nascent strand DNA abundance at the lamin B2, beta-globin and c-myc replication origins, respectively. Chromatin immunoprecipitation (ChIP) assays showed that the association of Ku80 with the lamin B2, beta-globin and c-myc origins was decreased by 1.5-, 2.3- and 2.5-fold, respectively, whereas that of Ku70 was similarly decreased (by 2.1-, 1.5- and 1.7-fold, respectively) in Ku80+/- cells. The results indicate that a deficiency of Ku80 resulted in a prolonged G1 phase, as well as decreased Ku binding to and activation of origins of DNA replication.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».