Induction of Collagenase mRNA Expression in Dermal Fibroblasts by IFN- <i>α</i> 2b and Determination of the IFN- <i>α</i> 2b Responsive Element on 5′-Flanking Regions of Collagenase Promoter
Notice bibliographique
Résumé
We have previously demonstrated that interferon-alpha2b (IFN-alpha2b) markedly depresses the expression of mRNA for type I procollagen in dermal fibroblasts. In the present study, the effect of various concentrations of IFN-alpha2b on the expression of collagenase mRNA and activity of 5'-flanking regions of collagenase promoter in dermal fibroblasts are presented. The results showed at least a 2-fold increase in the expression of collagenase mRNA in fibroblasts grown at either 70% confluency (40.9 +/- 4.6 vs. 18.5 +/- 1.6, n=4, p<0.05) or 95% confluency (24.7 +/- 6.7 vs. 4.5 +/- 1.6, n=4, p<0.05). The effects of IFN-alpha2b on collagenase mRNA stability and promoter activity were evaluated to determine the mechanism by which IFN-alpha2b increases the expression of collagenase mRNA. IFN-alpha2b-treated and untreated fibroblasts were treated with alpha-amanitin to arrest collagenase mRNA transcription, and total RNA was then harvested at 0, 3, 6, 12, and 24 h. The decay curves of collagenase mRNA as a function of time showed a greater rate of degradation for collagenase mRNA in IFN-alpha2b-treated cells relative to untreated control cells. This difference was more pronounced in cells treated with alpha-amanitin at either 12 or 24 h. To determine the regions of the collagenase promoter that might function as IFN-alpha2b responsive elements, eight different fragments of the collagenase promoter, -518, -300, -171, -161, -127, -91, -74, and -66 to +63 nucleotide (nt), were constructed in a chloramphenicol acetyltransferase (CAT) expression vector. The results of CAT activity of cells transfected with these construct identified three constructs, 171/+63, -161/+63, and -127/+63, as being responsive to IFN-alpha2b treatment in dermal fibroblasts. The CAT activity was increased 279%, 163%, and 261% in -171/+63, -161/+63, and -127/+63-transfected fibroblasts, respectively, in response to IFN-alpha2b treatment relative to untreated control. No significant increase in CAT activity was found in cells transfected with the other constructs of the collagenase promoter. A time response experiment showed a marked increase in CAT activity of cells transfected with either 127/+63 or -171/63 constructs within 6-12 hr of IFN-alpha2b treatment. In conclusion, IFN-alpha2b significantly increases the expression of collagenase mRNA in dermal fibroblasts probably through stimulation of the -127/-91 region of the collagenase promoter. Thus, this region may function as an IFN-alpha2b responsive element on collagenase promoter.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».