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Enregistrement W2067400755 · doi:10.1089/10799900152547876

Induction of Collagenase mRNA Expression in Dermal Fibroblasts by IFN- <i>α</i> 2b and Determination of the IFN- <i>α</i> 2b Responsive Element on 5′-Flanking Regions of Collagenase Promoter

2001· article· en· W2067400755 sur OpenAlexafffund
Aziz Ghahary, Edward E. Tredget, Qiong Shen

Notice bibliographique

RevueJournal of Interferon & Cytokine Research · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSkin and Cellular Biology Research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchSick Kids Foundation
Mots-clésCollagenaseMolecular biologyMessenger RNAInterstitial collagenaseGene expressionTranscription (linguistics)ChemistryBiologyGeneEnzymeBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have previously demonstrated that interferon-alpha2b (IFN-alpha2b) markedly depresses the expression of mRNA for type I procollagen in dermal fibroblasts. In the present study, the effect of various concentrations of IFN-alpha2b on the expression of collagenase mRNA and activity of 5'-flanking regions of collagenase promoter in dermal fibroblasts are presented. The results showed at least a 2-fold increase in the expression of collagenase mRNA in fibroblasts grown at either 70% confluency (40.9 +/- 4.6 vs. 18.5 +/- 1.6, n=4, p<0.05) or 95% confluency (24.7 +/- 6.7 vs. 4.5 +/- 1.6, n=4, p<0.05). The effects of IFN-alpha2b on collagenase mRNA stability and promoter activity were evaluated to determine the mechanism by which IFN-alpha2b increases the expression of collagenase mRNA. IFN-alpha2b-treated and untreated fibroblasts were treated with alpha-amanitin to arrest collagenase mRNA transcription, and total RNA was then harvested at 0, 3, 6, 12, and 24 h. The decay curves of collagenase mRNA as a function of time showed a greater rate of degradation for collagenase mRNA in IFN-alpha2b-treated cells relative to untreated control cells. This difference was more pronounced in cells treated with alpha-amanitin at either 12 or 24 h. To determine the regions of the collagenase promoter that might function as IFN-alpha2b responsive elements, eight different fragments of the collagenase promoter, -518, -300, -171, -161, -127, -91, -74, and -66 to +63 nucleotide (nt), were constructed in a chloramphenicol acetyltransferase (CAT) expression vector. The results of CAT activity of cells transfected with these construct identified three constructs, 171/+63, -161/+63, and -127/+63, as being responsive to IFN-alpha2b treatment in dermal fibroblasts. The CAT activity was increased 279%, 163%, and 261% in -171/+63, -161/+63, and -127/+63-transfected fibroblasts, respectively, in response to IFN-alpha2b treatment relative to untreated control. No significant increase in CAT activity was found in cells transfected with the other constructs of the collagenase promoter. A time response experiment showed a marked increase in CAT activity of cells transfected with either 127/+63 or -171/63 constructs within 6-12 hr of IFN-alpha2b treatment. In conclusion, IFN-alpha2b significantly increases the expression of collagenase mRNA in dermal fibroblasts probably through stimulation of the -127/-91 region of the collagenase promoter. Thus, this region may function as an IFN-alpha2b responsive element on collagenase promoter.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,444

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2001
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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