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Enregistrement W2067400755 · doi:10.1089/10799900152547876

Induction of Collagenase mRNA Expression in Dermal Fibroblasts by IFN- <i>α</i> 2b and Determination of the IFN- <i>α</i> 2b Responsive Element on 5′-Flanking Regions of Collagenase Promoter

2001· article· en· W2067400755 sur OpenAlexafffund
Aziz Ghahary, Edward E. Tredget, Qiong Shen

Notice bibliographique

RevueJournal of Interferon & Cytokine Research · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSkin and Cellular Biology Research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchSick Kids Foundation
Mots-clésCollagenaseMolecular biologyMessenger RNAInterstitial collagenaseGene expressionTranscription (linguistics)ChemistryBiologyGeneEnzymeBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have previously demonstrated that interferon-alpha2b (IFN-alpha2b) markedly depresses the expression of mRNA for type I procollagen in dermal fibroblasts. In the present study, the effect of various concentrations of IFN-alpha2b on the expression of collagenase mRNA and activity of 5'-flanking regions of collagenase promoter in dermal fibroblasts are presented. The results showed at least a 2-fold increase in the expression of collagenase mRNA in fibroblasts grown at either 70% confluency (40.9 +/- 4.6 vs. 18.5 +/- 1.6, n=4, p<0.05) or 95% confluency (24.7 +/- 6.7 vs. 4.5 +/- 1.6, n=4, p<0.05). The effects of IFN-alpha2b on collagenase mRNA stability and promoter activity were evaluated to determine the mechanism by which IFN-alpha2b increases the expression of collagenase mRNA. IFN-alpha2b-treated and untreated fibroblasts were treated with alpha-amanitin to arrest collagenase mRNA transcription, and total RNA was then harvested at 0, 3, 6, 12, and 24 h. The decay curves of collagenase mRNA as a function of time showed a greater rate of degradation for collagenase mRNA in IFN-alpha2b-treated cells relative to untreated control cells. This difference was more pronounced in cells treated with alpha-amanitin at either 12 or 24 h. To determine the regions of the collagenase promoter that might function as IFN-alpha2b responsive elements, eight different fragments of the collagenase promoter, -518, -300, -171, -161, -127, -91, -74, and -66 to +63 nucleotide (nt), were constructed in a chloramphenicol acetyltransferase (CAT) expression vector. The results of CAT activity of cells transfected with these construct identified three constructs, 171/+63, -161/+63, and -127/+63, as being responsive to IFN-alpha2b treatment in dermal fibroblasts. The CAT activity was increased 279%, 163%, and 261% in -171/+63, -161/+63, and -127/+63-transfected fibroblasts, respectively, in response to IFN-alpha2b treatment relative to untreated control. No significant increase in CAT activity was found in cells transfected with the other constructs of the collagenase promoter. A time response experiment showed a marked increase in CAT activity of cells transfected with either 127/+63 or -171/63 constructs within 6-12 hr of IFN-alpha2b treatment. In conclusion, IFN-alpha2b significantly increases the expression of collagenase mRNA in dermal fibroblasts probably through stimulation of the -127/-91 region of the collagenase promoter. Thus, this region may function as an IFN-alpha2b responsive element on collagenase promoter.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2001
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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