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Enregistrement W2067402889 · doi:10.1046/j.1365-2958.2002.02731.x

Mutational analysis of F‐pilin reveals domains for pilus assembly, phage infection and DNA transfer

2002· article· en· W2067402889 sur OpenAlexafffund
J. Manchak, Karen Anthony, Laura S. Frost

Notice bibliographique

RevueMolecular Microbiology · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésPilusPilinBiologyDNAMutantBacteriophageGeneticsMicrobiologyEscherichia coliGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The F-pilus has been implicated in recipient cell recognition during the establishment of a stable mating pair before conjugation as well as forming part of the conjugative pore for DNA transfer. The F-pilus is the site of attachment of the filamentous phages (M13, f1 and fd), which attach to the F-pilus tip, and the RNA phages, R17 and Qbeta, which attach to different sites exposed on the sides of the pilus. R17 has been shown to undergo eclipse, or capsid release, outside the cell on pili attached to cells. New and existing mutants of traA combined with natural variants of F-pilin were assayed for pilin stability and processing, pilus elongation, transfer, phage sensitivity and R17 eclipse. Phenotypes of these mutants indicated that the F-pilin subunit contains specific regions that can be associated with pilus assembly, phage sensitivity and DNA transport. Mutations involving lysines and phenylalanines within residues 45-60 suggest that these residues might participate in transmitting a signal down the length of the pilus that initiates DNA transfer or R17 eclipse.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,110
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations68
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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