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Enregistrement W2067969536 · doi:10.1002/prca.201100046

The salivary proteome: Challenges and perspectives

2011· review· en· W2067969536 sur OpenAlexafffund
Walter L. Siqueira, Colin Dawes

Notice bibliographique

RevuePROTEOMICS - CLINICAL APPLICATIONS · 2011
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSalivary Gland Disorders and Functions
Établissements canadiensUniversity of ManitobaWestern University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSalivaProteomeProteolysisSalivary ProteinsGingivitisSecretionBiologySalivary glandPhysiologyInternal medicineImmunologyMedicineBioinformaticsEndocrinologyBiochemistryEnzymeDentistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We provide a brief overview of the salivary proteome but with an emphasis on the major challenges in protein identification and quantitation. Precautions are necessary to avoid proteolysis, deglycosylation and dephosphorylation of salivary proteins by microbial and host enzymes in saliva. Many proteins are differentially expressed in secretions from different salivary glands and their proportional contributions to saliva vary with the flow rate. The total protein concentration in the secretion from any one gland varies considerably, depending on factors such as flow rate, duration of stimulation, nature of the stimulus and circadian rhythms. Many plasma proteins enter saliva via gingival crevicular fluid, of which there are increased amounts in persons with gingivitis or periodontal disease. These factors must be taken into account in the identification of potential biomarkers for different oral or systemic diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,004
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,290
Tête enseignante GPT0,427
Écart entre enseignants0,137 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations88
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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