A Bioorganometallic Approach for the Electrochemical Detection of Proteins: A Study on the Interaction of Ferrocene–Peptide Conjugates with Papain in Solution and on Au Surfaces
Notice bibliographique
Résumé
In this paper, a new bioorganometallic approach for the detection of proteins using surface-bound ferrocene-peptide conjugates is presented. Specifically, a series of peptide conjugates of 1'-aminoferrocene-1-carboxylic acid (ferrocene amino acid, Fca) is synthesized: Boc-Fca-Gly-Gly-Tyr(Bzl)-Arg(NO2)-OMe (2), Thc-Fca-Gly-Gly-Tyr(Bzl)-Arg(NO2)-OMe (3), Thc-Fca-Gly-Gly-Tyr(Bzl)-Arg(NO2)-OH (4), Boc-Fca-Gly-Gly-Arg(Mtr)-Tyr-OMe (7), Thc-Fca-Gly-Gly-Arg(Mtr)-Tyr-OMe (8), Thc-Fca-Gly-Gly-Arg(Mtr)-Tyr-OH (9), Thc-Fca-Gly-Gly-Arg-Tyr-OH (10). The peptide is conjugated to the C-terminal side of Fca and compounds 4, 7-10 possess a thiostic acid linked to the N-terminal side of Fca in order to facilitate formation of thin films on gold substrates. Competitive inhibition towards papain was determined for Thc-Fca-Gly-Gly-Tyr(Bzl)-Arg(NO2)-OH (4), Thc-Fca-Gly-Gly-Arg(Mtr)-Tyr-OH (9) and Thc-Fca-Gly-Gly-Arg-Tyr-OH (10). The binding interaction between the peptide modified substrates and papain enzyme was studied using real-time surface plasmon resonance (SPR) imaging. Peptide 10 showed the strongest binding affinity to papain. Adsorption/desorption rate constants were ka = 1.75+/-0.05 x 10(5) M(-1) s(-1) and kd = 2.90 +/- 0.05 x 10(-2) s(-1). Interactions of papain with Fca-peptide 10 were investigated by cyclic voltammetry. The interaction results were also verified by measuring the electrochemical response of the peptide-papain interaction as function of increasing enzyme concentration. A linear relationship was observed for papain concentration of up to 80 nM. Shifting to higher potentials as well as decrease in the overall signal intensity was observed. The detection limit was 4 x 10(-9) M.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».