MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2068389722 · doi:10.1074/jbc.m301590200

Identification of Ets-1 as an Important Transcriptional Activator of CTP: Phosphocholine Cytidylyltransferase α in COS-7 Cells and Co-activation with Transcriptional Enhancer Factor-4

2003· article· en· W2068389722 sur OpenAlexafffund
Hiroyuki Sugimoto, Sayaka Sugimoto, Kazuaki Tatei, Hideru Obinata, Marica Bakovic, Takashi Izumi, Dennis E. Vance

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Kinase Regulation and GTPase Signaling
Établissements canadiensUniversity of GuelphUniversity of AlbertaCanadian Institutes of Health Research
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNaito Foundation
Mots-clésPhosphocholineMolecular biologyEnhancerTranscription factorTransfectionTranscription (linguistics)Activator (genetics)LuciferaseReporter genePromoterBiologyTranscriptional regulationGene expressionChemistryGenePhosphatidylcholineBiochemistryPhospholipid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Phosphatidylcholine biosynthesis via the CDP-choline pathway is primarily regulated by CTP:phosphocholine cytidylyltransferase (CT). Transcriptional enhancer factor-4 (TEF-4) enhances the transcription of CTalpha in COS-7 cells by interactions with the basal transcription machinery (Sugimoto, H., Bakovic, M., Yamashita, S., and Vance, D.E. (2001) J. Biol. Chem. 276,12338-12344). To identify the most important transcription factor involved in basal CTalpha transcription, we made CTalpha promoter-deletion and -mutated constructs linked to a luciferase reporter and transfected them into COS-7 cells. The results indicate that an important site regulating basal CTalpha transcription is -53/-47 (GACTTCC), which is a putative consensus-binding site of Ets transcription factors (GGAA) in the opposite orientation. Gel shift analyses indicated the existence of a binding protein for -53/-47 (GACTTCC) in nuclear extracts of COS-7 cells. When anti-Ets-1 antibody was incubated with the probe in gel shift analyses, the intensity of the binding protein was decreased. The binding of endogenous Ets-1 to the promoter probe was increased when TEF-4 was expressed; however, the amount of Ets-1 detected by immunoblotting was unchanged. When cells were transfected with Ets-1 cDNA, the luciferase activity of CTalpha promoter constructs was greatly enhanced. Co-transfection experiments with Ets-1 and TEF-4 showed enhanced expression of reporter constructs as well as CTalpha mRNA. These results suggest that Ets-1 is an important transcriptional activator of the CTalpha gene and that Ets-1 activity is enhanced by TEF-4.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,431

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetProtein Kinase Regulation and GTPase SignalingTravaux en français237 207