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Enregistrement W2068391719 · doi:10.1007/s10295-004-0181-2

The effect of nitrogen source on yield and glycosylation of a human cystatin C mutant expressed in Pichia pastoris

2004· article· en· W2068391719 sur OpenAlexaff
Jason Pritchett, Susan A. Baldwin

Notice bibliographique

RevueJournal of Industrial Microbiology & Biotechnology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEnzyme Production and Characterization
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPichia pastorisGlycosylationBiochemistryChemistryCystatinMutantAmino acidAmmonium hydroxideCystatin CRecombinant DNAOrganic chemistryGeneCreatinine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human cystatin C is a cysteine proteinase inhibitor with potential applications as an anti-viral agent, cancer tumor growth inhibitor, and in prevention of proteolysis during food processing. A glycosylated cystatin C mutant with increased temperature stability was developed for the latter application [Nakamura et al. (1998) FEBS Lett 427:252-254]. A recombinant variant of cystatin C [Nakamura et al. (2000) International patent no. PLTCA99/00717] with two potential sites for N-linked glycosylation was expressed in Pichia pastoris Mut(s). Little of the cystatin C produced was in the glycosylated form under fermentation conditions of pH 6, temperature 28 degrees C, methanol only feed, and ammonium hydroxide as a nitrogen source. Thus, the effect of addition of complex nitrogen sources, peptone and amino acid supplements, on the yield and glycosylation of this mutant cystatin C were investigated. A full factorial design experiment using 2-l fermenters was performed with three factors: ammonium hydroxide, peptone, and an amino acid mix, at two levels, absent or present. Peptone addition was found to have a positive, and the most significant, effect on cell specific cystatin C yield. A maximum mutant cystatin C yield of 0.82 mumol (g-dry cell weight)(-1) min(-1) was obtained when all three nitrogen sources were used together. However, under these conditions only 16% of protein was in the glycosylated form since ammonia was found to have a significant negative effect on glycosylation extent. The maximum extent of glycosylation was 30% when peptone and amino acid mix were the only nitrogen sources added.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,463

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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