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Enregistrement W2068600199 · doi:10.1074/jbc.m010584200

Molecular Basis for the Susceptibility of Fibrin-bound Thrombin to Inactivation by Heparin Cofactor II in the Presence of Dermatan Sulfate but Not Heparin

2001· article· en· W2068600199 sur OpenAlexaff
Patricia C. Liaw, Debra L. Becker, Alan R. Stafford, James C. Fredenburgh, Jeffrey I. Weitz

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProteoglycans and glycosaminoglycans research
Établissements canadiensHamilton Health SciencesMcMaster University Medical Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésThrombinHeparin cofactor IIDermatan sulfateChemistryFibrinHeparinAntithrombinBiochemistryTernary complexHeparan sulfateImmunologyEnzymePlateletBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although fibrin-bound thrombin is resistant to inactivation by heparin.antithrombin and heparin.heparin cofactor II complexes, indirect studies in plasma systems suggest that the dermatan sulfate.heparin cofactor II complex can inhibit fibrin-bound thrombin. Herein we demonstrate that fibrin monomer produces a 240-fold decrease in the heparin-catalyzed rate of thrombin inhibition by heparin cofactor II but reduces the dermatan sulfate-catalyzed rate only 3-fold. The protection of fibrin-bound thrombin from inhibition by heparin.heparin cofactor II reflects heparin-mediated bridging of thrombin to fibrin that results in the formation of a ternary heparin.thrombin.fibrin complex. This complex, formed as a result of three binary interactions (thrombin.fibrin, thrombin.heparin, and heparin.fibrin), limits accessibility of heparin-catalyzed inhibitors to thrombin and induces conformational changes at the active site of the enzyme. In contrast, dermatan sulfate binds to thrombin but does not bind to fibrin. Although a ternary dermatan sulfate. thrombin.fibrin complex forms, without dermatan sulfate-mediated bridging of thrombin to fibrin, only two binary interactions exist (thrombin.fibrin and thrombin. dermatan sulfate). Consequently, thrombin remains susceptible to inactivation by heparin cofactor II. This study explains why fibrin-bound thrombin is susceptible to inactivation by heparin cofactor II in the presence of dermatan sulfate but not heparin.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,347

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations98
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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