Evolution of glutamine synthetase in vertebrates: multiple glutamine synthetase genes expressed in rainbow trout (<i>Oncorhynchus mykiss)</i>
Notice bibliographique
Résumé
Glutamine synthetase (GSase) is a key enzyme in nitrogen metabolism and encoded by a single gene in mammals. Using PCR cloning techniques, including RT-PCR from total RNA and PCR from a cDNA library, we find evidence of four expressed GSase mRNAs for the tetraploid rainbow trout. For two of these mRNAs (Onmy-GS01, -GS02) we characterize the full-length coding regions, and for two others (Onmy-GS03, -GS04), we describe partial sequences. Northern analysis of Onmy-GS01, -GS02, -GS03 and -GS04 indicates that (1) Onmy-GS02 is expressed at higher levels relative to the other transcripts in most adult tissues, with the exception of brain and gill, where Onmy-GS01 is at the highest level, and (2) the tissue with the highest level of expression of all four transcripts is the brain, with decreasing levels in the intestine, liver, red muscle, gill/kidney, white muscle and heart. Clearly, rainbow trout possess multiple GSase genes with differing levels of tissue expression, implying manifold potential routes of regulation for this octameric enzyme. Our data also indicate that caution should be taken when interpreting mRNA expression data of a single gene, unless multiple genes have been ruled out. Consistent with a southern blot, phylogenetic and intron sequence analyses imply that the trout genes are encoded by at least four separate loci, belonging to two distinct evolutionary branches. Our data on rainbow trout, together with those from two full-length zebrafish Danio rerio GSase genes compiled from GenBank ESTs, support the idea that fish GSases are polyphyletic and that gene duplications have occurred at multiple points and in independent lineages throughout the evolution of bony fishes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».