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Enregistrement W2068777287 · doi:10.1021/bm060280w

Characterization by Raman Microspectroscopy of the Strain-Induced Conformational Transition in Fibroin Fibers from the Silkworm<i> Samia </i><i>c</i><i>ynthia </i><i>r</i><i>icini</i>

2006· article· he· W2068777287 sur OpenAlexaff
Marie‐Eve Rousseau, L.-P.B. Beaulieu, Thierry Lefèvre, Joanie Paradis, Tetsuo Asakura, Michel Pézolet

Notice bibliographique

RevueBiomacromolecules · 2006
Typearticle
Languehe
DomaineMaterials Science
ThématiqueSilk-based biomaterials and applications
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFibroinRaman spectroscopyCrystallographyFiberDeformation (meteorology)Strain (injury)ChemistryHelix (gastropod)Materials scienceCharacterization (materials science)SILKComposite materialNanotechnologyOpticsPhysicsAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Raman microspectroscopy has been used to quantitatively study the effect of a mechanical deformation on the conformation and orientation of Samia cynthia ricini (S. c. ricini) silk fibroin. Samples were obtained from the aqueous solution stored in the silk gland and stretched at draw ratios (lambda) ranging from 0 to 11. Using an appropriate band decomposition procedure, polarized and orientation-insensitive spectra have been analyzed to determine order parameters and the content of secondary structures, respectively. The data unambiguously show that, in response to mechanical deformation, S. c. ricini fibroin undergoes a cooperative alpha-helix to beta-sheet conformational transition above a critical draw ratio of 4. The alpha-helix content decreases from 33 to 13% when lambda increases from 0 to 11, while the amount of beta-sheets increases from 15 to 37%. In comparison, cocoon silk is devoid of alpha-helical structure and always contains a larger amount of beta-sheets. Although the presence of isosbestic points in different spectral regions reveals that the conformational change induced by mechanical deformation is a two-state process, our results suggest that part of the glycine residues might be incorporated into beta-poly(alanine) structures. The beta-sheets are initially isotropically distributed and orient along the fiber axis as lambda increases, but do not reach the high level of orientation found in the cocoon fiber. The increase in the orientation level of the beta-sheets is found to be concomitant with the alpha --> beta conformational conversion, whereas alpha-helices do not orient under the applied strain but are rather readily converted into beta-sheets. The components assigned to turns exhibit a small orientation perpendicular to the fiber axis in stretched samples, showing that, overall, the polypeptide chains are aligned along the stretching direction. Our results suggest that, in nature, factors other than stretching contribute to the optimization of the amount of beta-sheets and the high degree of orientation found in natural cocoon silk.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,001

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations79
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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