Detection and quantification of <i>Leptographium wageneri</i>, the cause of black-stain root disease, from bark beetles (Coleoptera: Scolytidae) in Northern California using regular and real-time PCR
Notice bibliographique
Résumé
Black-stain root disease is a threat to conifer forests in western North America. The disease is caused by the ophiostomatoid fungus Leptographium wageneri (W.B. Kendr.) M.J. Wingf., which is associated with a number of bark beetle (Coleoptera: Scolytidae) and weevil species (Coleoptera: Curculionidae). We developed a polymerase chain reaction test to identify and quantify fungal DNA directly from insects. Leptographium wageneri DNA was detected on 142 of 384 bark beetle samples (37%) collected in Lassen National Forest, in northeastern California, during the years 2001 and 2002. Hylastes macer (LeConte) was the bark beetle species from which Leptographium DNA was amplified most regularly (2001: 63.4%, 2002: 75.0% of samples). Lower insectfungus association rates were found for Hylurgops porosus (LeConte), Hylurgops subcostulatus (Mannerheim), Hylastes gracilis (LeConte), Hylastes longicollis (Swaine), Dendroctonus valens (LeConte), and Ips pini (Say). The spore load per beetle ranged from 0 to over 1 × 10 5 spores, with only a few beetles carrying more than 1 × 10 3 spores. The technique permits the processing of a large number of samples synchronously, as required for epidemiological studies, to study infection rates in bark beetle populations and to identify potential insect vectors.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».