Abstract 4023: Novel role of neurofibromin in transport of RNA granules
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Neurofibromatosis 1 (NF1) is the most common tumor predisposing syndrome in humans, with an incidence of 1:3500 live births. Neurofibromin, encoded by Nf1, acts as a p21-Ras-GAP to directly interact with and inactivate p21-Ras, through its’ GAP Related Domain (GRD). Evidence suggests that non-Ras-GAP functions mediated through interactions with domains outside of the GRD are of importance. By making a number of NF1-GST domain constructs coupled with differential Mass Spec analysis, we identified LRPPRC and Dynein as previously unreported NF1-TBD interacting proteins. LRPPRC was of interest as it is mutated in the Leigh Syndrome French Canadian (LSFC) variant, a cytochrome-oxidase deficiency syndrome, characterized by neurodegeneration, developmental- mental- and growth-retardation, thereby having some similarities with non-tumor manifestations of NF1. We have established that LRPPRC and neurofibromin interact in vitro by immunoprecipitation and reverse bait immunoprecipitation. Use of a novel Proximity Ligation Assay (PLA) was used to further confirm the interaction in situ in cell lines and clinical tissue cryosections. Towards elucidating the functional relevance of the interaction, we have established that the two proteins complex with microtubules and motor proteins, which indicates a role in microtubule-dependant intracellular transport. Since LRPPRC binds with mRNA and is involved in its nucleocytosolic shuttling, we hypothesize that the cargo transported by this complex could be RNA granules. Mass Spec analysis of NF1 immunoprecipitates revealed a number of proteins that are a part of the RNA granule complex which include RNA binding proteins and proteins involved in mRNA translation. By performing RNA Immunoprecipitation (RIP) with NF1 and LRPPRC antibodies, we have demonstrated that the two proteins do complex with 18S and 28S rRNA which is indicative of the presence of intact mRNA. Towards identifying the specific messages transported by the NF1-LRPPRC RNA granule complex we are performing RIP - microarray gene expression profiling (CHIP). The resultant candidate mRNAs will be further investigated to understand the importance of this novel interaction and novel mechanism towards some of the overlap of neurological and developmental manifestations between LSFC and NF1. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 101st Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2010 Apr 17-21; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2010;70(8 Suppl):Abstract nr 4023.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».