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Enregistrement W2069650462 · doi:10.4141/cjps07145

Identification of anthracnose resistance genes in dry bean cultivars grown in Manitoba

2008· article· en· W2069650462 sur OpenAlexafffundvenueabout
R. L. Conner, Kangfu Yu, Parthiba Balasubramanian, Waldo C. Penner, L. M. Yager

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Science · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant pathogens and resistance mechanisms
Établissements canadiensUniversity of LethbridgeAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaCollege of Engineering, Michigan State UniversityMichigan State University
Mots-clésCultivarPhaseolusColletotrichum lindemuthianumBiologyDry beanPinto beanGenotypeRAPDHorticultureGene poolGeneResistance (ecology)BotanyGenetic diversityAgronomyGeneticsPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Previously described random amplified polymorphic DNA (RAPD) and sequence characterized amplified region (SCAR) markers were used to identify specific genes for anthracnose resistance in 20 dry bean (Phaseolus vulgaris) cultivars and one breeding line. These included six navy bean, five black bean, three kidney bean, two great northern bean, two pinto bean, one cranberry bean, one pink bean and one small red bean cultivars. The reactions of these bean cultivars to five races (i.e., races 23, 31, 73, 81, 105) of Colletotrichum lindemuthianum were used to verify the results of the molecular marker tests. The combined analysis of genotypes estimated with markers and race reactions showed that navy bean cultivar Envoy carried gene Co-1 2 , possibly in combination with other resistance genes, which conferred resistance to all the races except race 105. The bean cultivars Morden003, Messina and CDC Nordic carried Co-1 5 , which provided resistance to only races 73 and 105. Resistance in AC Mariner appeared to be controlled by gene Co-2 either alone or possibly in combination with Co-11. The kidney bean cultivars Chardonnay and ROG 802 carried resistance gene Co-1. Eight other cultivars were resistant to races 23 and 31, which indicated that they carried resistance gene Co-3 or another unidentified resistance gene. Six dry bean cultivars were susceptible to all five anthracnose races. Genotype estimates were based primarily on the virulence pattern of the races on specific cultivars. The results from the molecular tests sometimes supported the proposed genotypes based on the results from the race inoculations, but false positive results often occurred with molecular markers for genes Co-2 and Co-4. Virulence pattern information allowed the detection of specific resistance genes in certain cultivars, but did not always rule out the presence of other genes. Key words: Disease resistance, gene identification, anthracnose (Colletotrichum lindemuthianum), dry bean (Phaseolus vulgaris), molecular marker

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,872
Score d'incertitude au seuil0,579

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,176 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2008
Routes d'admission4
Résumé présentoui

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