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Enregistrement W2069763648 · doi:10.1021/bi801363b

Crystal Structure and Enantiomer Selection by <scp>d</scp>-Alanyl Carrier Protein Ligase DltA from <i>Bacillus cereus</i>

2008· article· en· W2069763648 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueEnzyme Structure and Function
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTeichoic acidDNA ligaseBacillus cereusCereusBiochemistryBacillus subtilisBiologyChemistryBacteriaPeptidoglycanCell wallDNAGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ubiquitous D-alanylation of lipoteichoic acids modulates the surface charge and ligand binding of the gram-positive cell wall. Disruption of the bacterial DltABCD gene involved in teichoic acid alanylation, as well as inhibition of the DltA protein, has been shown to increase a gram-positive bacterium's susceptibility to antibiotics. The DltA D-alanyl carrier protein ligase promotes a two-step process starting with adenylation of D-alanine. We have determined the 2.0 A resolution crystal structure of a DltA protein from Bacillus cereus in complex with the D-alanine adenylate intermediate of the first reaction. Despite the low level of sequence similarity, the DltA structure resembles known structures of adenylation domains such as the acetyl-CoA synthetase. The enantiomer selection appears to be enhanced by the medium-sized side chain of Cys-269. The Ala-269 mutant protein shows marked loss of such selection. The network of noncovalent interactions between the D-alanine adenylate and DltA provides structure-based rationale for aiding the design of tight-binding DltA inhibitors for combating infectious gram-positive bacteria such as the notorious methicillin-resistant Staphylococcus aureus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,891

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,185
Écart entre enseignants0,180 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle