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Enregistrement W2069798450 · doi:10.1210/jcem.87.2.8253

A Single Nucleotide Polymorphism in Protein Tyrosine Phosphatase PTP-1B Is Associated with Protection from Diabetes or Impaired Glucose Tolerance in Oji-Cree

2002· article· en· W2069798450 sur OpenAlexaffabout
Andrea Tsz Ching Mok, Henian Cao, Bernard Zinman, Anthony J. Hanley, Stewart B. Harris, Brian P. Kennedy, Robert A. Hegele

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Clinical Endocrinology & Metabolism · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Tyrosine Phosphatases
Établissements canadiensWestern UniversityUniversity of TorontoRobarts Clinical Trials
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenotypeSingle-nucleotide polymorphismBiologySNPProtein tyrosine phosphataseImpaired glucose toleranceAlleleGeneticsEndocrinologyInternal medicineDiabetes mellitusType 2 diabetesGeneMedicineKinase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Several lines of evidence support a role for protein tyrosine phosphatase 1B (PTP-1B) in metabolism, and specifically in insulin sensitivity and obesity. We report the development of reagents for the amplification and sequencing of the PTP-1B gene, which has resulted in the identification of a novel single nucleotide polymorphism (SNP), designated 981C-->T. We found a significant association between this SNP and the risk of either impaired glucose tolerance (IGT) or type 2 diabetes in the Oji-Cree of Sandy Lake, Ontario, Canada. Six hundred and fifty-three subjects were genotyped using PCR amplification of exon 8, followed by digestion with the restriction enzyme AvaI. Sixty-eight subjects were heterozygotes, and none was a homozygote. Thus, the overall frequencies of the C allele and the T allele were 0.948 and 0.052, respectively. Subjects with the PTP-1B 981T/981C genotype were approximately 40% less likely to have IGT or diabetes as subjects with the 981C/981C genotype (P = 0.040). There was no difference in quantitative traits among subjects grouped according to the PTP-1B 981C-->T SNP genotype. These very preliminary findings suggest that genomic variation in PTP-1B is associated with a reduced risk of diabetes and are consistent with the idea that this protein is important in metabolism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,139
Score d'incertitude au seuil0,949

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations71
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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