A Single Nucleotide Polymorphism in Protein Tyrosine Phosphatase PTP-1B Is Associated with Protection from Diabetes or Impaired Glucose Tolerance in Oji-Cree
Notice bibliographique
Résumé
Several lines of evidence support a role for protein tyrosine phosphatase 1B (PTP-1B) in metabolism, and specifically in insulin sensitivity and obesity. We report the development of reagents for the amplification and sequencing of the PTP-1B gene, which has resulted in the identification of a novel single nucleotide polymorphism (SNP), designated 981C-->T. We found a significant association between this SNP and the risk of either impaired glucose tolerance (IGT) or type 2 diabetes in the Oji-Cree of Sandy Lake, Ontario, Canada. Six hundred and fifty-three subjects were genotyped using PCR amplification of exon 8, followed by digestion with the restriction enzyme AvaI. Sixty-eight subjects were heterozygotes, and none was a homozygote. Thus, the overall frequencies of the C allele and the T allele were 0.948 and 0.052, respectively. Subjects with the PTP-1B 981T/981C genotype were approximately 40% less likely to have IGT or diabetes as subjects with the 981C/981C genotype (P = 0.040). There was no difference in quantitative traits among subjects grouped according to the PTP-1B 981C-->T SNP genotype. These very preliminary findings suggest that genomic variation in PTP-1B is associated with a reduced risk of diabetes and are consistent with the idea that this protein is important in metabolism.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».