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Enregistrement W2070667288 · doi:10.1261/rna.2910105

Regulation of 5′ template usage and incorporation of noncognate nucleotides by human telomerase

2005· article· en· W2070667288 sur OpenAlexafffund
Tara J. Moriarty, Delphine T. Marie‐Egyptienne, Chantal Autexier

Notice bibliographique

RevueRNA · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTelomeres, Telomerase, and Senescence
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMcGill University
Mots-clésBiologyTelomereTelomeraseTelomerase reverse transcriptaseReverse transcriptaseRNADNATranscription (linguistics)NucleotideTelomerase RNA componentMolecular biologyMutantCell biologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Telomerase accurately synthesizes telomeric DNA by reverse transcription of a tightly defined template region in the telomerase RNA (TR). Reverse transcription past the 5' boundary of the template can cause the incorporation of noncognate nucleotides into telomeric DNA, which can result in disruption of normal telomere function. The products synthesized by human telomerase do not contain the nucleotide cytosine, which is encoded by an hTR residue 2 nucleotides (nt) 5' of the template boundary. We examined dCTP incorporation by a series of telomerases reconstituted with N- and C-terminally mutated human telomerase reverse transcriptases (hTERTs). We found that altering sequences in the N-terminal RNA interaction domain 1 (RID1) and C terminus caused dCTP-dependent catalytic phenotypes suggestive of reverse transcription of sequences 5' of the template boundary. A RID1 mutant that exhibited a dCTP-dependent phenotype interacted less efficiently with a human telomerase RNA (hTR) variant in which the 5' template boundary-defining P1b element was disrupted, whereas C-terminal mutations did not alter hTR interactions in a P1b-dependent fashion. Disruption of P1b or template linker sequences between P1b and the 5' template boundary also impaired 5' template usage in RID1 and C-terminal hTERT mutants. These observations identify overlapping roles for hTR sequences and structures 5' of the template in regulating both 5' template boundary definition and 5' template usage, and implicate hTERT N- and C-terminal regions in 5' template usage and suppression of noncognate nucleotide incorporation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,241
Score d'incertitude au seuil0,392

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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