Regulation of 5′ template usage and incorporation of noncognate nucleotides by human telomerase
Notice bibliographique
Résumé
Telomerase accurately synthesizes telomeric DNA by reverse transcription of a tightly defined template region in the telomerase RNA (TR). Reverse transcription past the 5' boundary of the template can cause the incorporation of noncognate nucleotides into telomeric DNA, which can result in disruption of normal telomere function. The products synthesized by human telomerase do not contain the nucleotide cytosine, which is encoded by an hTR residue 2 nucleotides (nt) 5' of the template boundary. We examined dCTP incorporation by a series of telomerases reconstituted with N- and C-terminally mutated human telomerase reverse transcriptases (hTERTs). We found that altering sequences in the N-terminal RNA interaction domain 1 (RID1) and C terminus caused dCTP-dependent catalytic phenotypes suggestive of reverse transcription of sequences 5' of the template boundary. A RID1 mutant that exhibited a dCTP-dependent phenotype interacted less efficiently with a human telomerase RNA (hTR) variant in which the 5' template boundary-defining P1b element was disrupted, whereas C-terminal mutations did not alter hTR interactions in a P1b-dependent fashion. Disruption of P1b or template linker sequences between P1b and the 5' template boundary also impaired 5' template usage in RID1 and C-terminal hTERT mutants. These observations identify overlapping roles for hTR sequences and structures 5' of the template in regulating both 5' template boundary definition and 5' template usage, and implicate hTERT N- and C-terminal regions in 5' template usage and suppression of noncognate nucleotide incorporation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».