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Enregistrement W2070999406 · doi:10.1093/carcin/bgu326

Inherited variants in the inner centromere protein (INCENP) gene of the chromosomal passenger complex contribute to the susceptibility of ER-negative breast cancer

2015· article· en· W2070999406 sur OpenAlexafffund
Maria Kabisch, Justo Lorenzo Bermejo, Thomas Dünnebier, Shibo Ying, Kyriaki Michailidou, Manjeet K. Bolla, Qin Wang, Joe Dennis, Mitul Shah, Barbara Perkins, Kamila Czene, Hatef Darabi, Mikael Eriksson, Stig E. Bojesen, Børge G. Nordestgaard, Sune F. Nielsen, Henrik Flyger, Diether Lambrechts, Patrick Neven, Stéphanie Peeters, Caroline Weltens, Fergus J. Couch, Janet E. Olson, Xianshu Wang, Kristen S. Purrington, Jenny Chang‐Claude, Anja Rudolph, Petra Seibold, Dieter Flesch‐Janys, Julian Peto, Isabel dos‐Santos‐Silva, Nichola Johnson, Olivia Fletcher, Heli Nevanlinna, Taru Muranen, Kristiina Aittomäki, Carl Blomqvist, Marjanka K. Schmidt, Annegien Broeks, Sten Cornelissen, Frans B.L. Hogervorst, Jingmei Li, Judith S. Brand, Keith Humphreys, Pascal Guénel, Thérèse Truong, F. Ménégaux, Barbara Burwinkel, Frederik Marmé, Rongxi Yang, Peter Bugert, Anna González‐Neira, Javier Benı́tez, M. Pilar Zamora, José Ignacio Arias Pérez, Angela Cox, Simon S. Cross, Malcolm Reed, Irene L. Andrulis, Julia A. Knight, Gord Glendon, Sandrine Tchatchou, Elinor J. Sawyer, Ian Tomlinson, Michael J. Kerin, Nicola Miller, Christopher A. Haiman, Fredrick R. Schumacher, Brian E. Henderson, Loı̈c Le Marchand, Annika Lindblom, Sara Margolin, Maartje J. Hooning, Antoinette Hollestelle, Mieke Kriege, Linetta B. Koppert, John L. Hopper, Melissa C. Southey, Helen Tsimiklis, Carmel Apicella, Seth W. Slettedahl, Amanda E. Toland, Celine M. Vachon, Drakoulis Yannoukakos, Graham G. Giles, Roger L. Milne, Catriona McLean, Peter A. Fasching, Matthias Ruebner, Arif B. Ekici, Matthias W. Beckmann, Hermann Brenner, Aida Karina Dieffenbach, Volker Arndt, Christa Stegmaier, Alan Ashworth, Minouk J. Schoemaker, Anthony J. Swerdlow, Montserrat García‐Closas, Jonine D. Figueroa, Stephen J. Chanock, Jolanta Lissowska, Mark S. Goldberg, France Labrèche, Martine Dumont, Robert Winqvist, Katri Pylkäs, Arja Jukkola‐Vuorinen, Mervi Grip, Hiltrud Brauch, Thomas Brüning, Yon‐Dschun Ko, Paolo Radice, Paolo Peterlongo, Giulietta Scuvera, Stefano Fortuzzi, Natalia Bogdanova, Thilo Dörk, Arto Mannermaa, Vesa Kataja, Veli‐Matti Kosma, Jaana M. Hartikainen, Peter Devilee, Robert A.E.M. Tollenaar, Caroline Seynaeve, Christi J. van Asperen, Anna Jakubowska, Jan Lubiński, Katarzyna Jaworska–Bieniek, Katarzyna Durda, Wei Zheng, Martha J. Shrubsole, Qiuyin Cai, Diana Torres, Hoda Anton‐Culver, Vessela N. Kristensen, François Bacot, Daniel C. Tessier, Daniel Vincent, Craig Luccarini, Caroline Baynes, Shahana Ahmed, Mel Maranian, Jacques Simard, Georgia Chenevix‐Trench, Per Hall, Paul D.P. Pharoah, Alison M. Dunning, Douglas F. Easton, Ute Hamann

Notice bibliographique

RevueCarcinogenesis · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Chromatin Dynamics
Établissements canadiensMcGill University and Génome Québec Innovation CentreUniversité LavalRoyal Victoria HospitalCentre hospitalier universitaire de QuébecSante MontrealMcGill UniversityMcGill University Health CentreUniversité de MontréalRoyal Victoria Regional Health CentreMount Sinai HospitalLunenfeld-Tanenbaum Research InstitutePublic Health OntarioUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteUniversitätsklinikum Hamburg-EppendorfInstituto de Salud Carlos IIIMedical Research CouncilNational Institutes of HealthAkershus UniversitetssykehusRheinische Friedrich-Wilhelms-Universität BonnMinistero dello Sviluppo EconomicoAgence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du TravailNational Health and Medical Research CouncilOulun YliopistoDeutsche KrebshilfeMedizinischen Hochschule HannoverNorges ForskningsrådInstitut National Du CancerLeids Universitair Medisch CentrumUniversitetet i BergenStockholms Läns LandstingKuopion Yliopistollinen SairaalaKarolinska InstitutetCanadian Institutes of Health ResearchGeneral Secretariat for Research and TechnologyOvarian Cancer Research FundBundesministerium für Bildung und ForschungMinisterio de Economía y CompetitividadDeutsche Gesetzliche UnfallversicherungNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekFonds Wetenschappelijk OnderzoekCancerfondenCancer AustraliaAgence Nationale de la RechercheRobert Bosch StiftungNational Breast Cancer FoundationEuropean CommissionHerlev HospitalUniversity of Southern CaliforniaAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroBeckman Research Institute, City of HopeCancer Research UKEberhard Karls Universität TübingenFondation du cancer du sein du QuébecKing's College LondonAcademy of FinlandGénome QuébecNational Institute for Health and Care ResearchItä-Suomen YliopistoMinistère du Développement Économique, de l’Innovation et de l’ExportationLon V. Smith FoundationEuropean Social FundAgency for Science, Technology and ResearchFrancis Crick InstituteMcGill University Health CentreUniversity of California, IrvineDavid F. and Margaret T. Grohne Family FoundationMedisinske fakultet, Universitetet i OsloLigue Contre le CancerDeutsches KrebsforschungszentrumBreast Cancer Research FoundationMcGill UniversityHelsingin ja Uudenmaan SairaanhoitopiiriSusan G. Komen for the CureNIHR Biomedical Research Centre, Royal Marsden NHS Foundation Trust/Institute of Cancer ResearchFondation de FranceUniversitetet i OsloSundhed og Sygdom, Det Frie ForskningsrådCancer Council VictoriaCalifornia Department of Public HealthHaukeland UniversitetssjukehusU.S. Department of Health and Human ServicesUniversitetet i TromsøUniversity of Cambridge
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismBreast cancerGeneticsBiologyAlleleOdds ratioEstrogen receptorOncologySNPCancerGenotypeInternal medicineMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The chromosomal passenger complex (CPC) plays a pivotal role in the regulation of cell division. Therefore, inherited CPC variability could influence tumor development. The present candidate gene approach investigates the relationship between single nucleotide polymorphisms (SNPs) in genes encoding key CPC components and breast cancer risk. Fifteen SNPs in four CPC genes (INCENP, AURKB, BIRC5 and CDCA8) were genotyped in 88 911 European women from 39 case-control studies of the Breast Cancer Association Consortium. Possible associations were investigated in fixed-effects meta-analyses. The synonymous SNP rs1675126 in exon 7 of INCENP was associated with overall breast cancer risk [per A allele odds ratio (OR) 0.95, 95% confidence interval (CI) 0.92-0.98, P = 0.007] and particularly with estrogen receptor (ER)-negative breast tumors (per A allele OR 0.89, 95% CI 0.83-0.95, P = 0.0005). SNPs not directly genotyped were imputed based on 1000 Genomes. The SNPs rs1047739 in the 3' untranslated region and rs144045115 downstream of INCENP showed the strongest association signals for overall (per T allele OR 1.03, 95% CI 1.00-1.06, P = 0.0009) and ER-negative breast cancer risk (per A allele OR 1.06, 95% CI 1.02-1.10, P = 0.0002). Two genotyped SNPs in BIRC5 were associated with familial breast cancer risk (top SNP rs2071214: per G allele OR 1.12, 95% CI 1.04-1.21, P = 0.002). The data suggest that INCENP in the CPC pathway contributes to ER-negative breast cancer susceptibility in the European population. In spite of a modest contribution of CPC-inherited variants to the total burden of sporadic and familial breast cancer, their potential as novel targets for breast cancer treatment should be further investigated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,740
Score d'incertitude au seuil0,380

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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