Delimiting Species Boundaries in Rosa Sect. Cinnamomeae (Rosaceae) in Eastern North America
Notice bibliographique
Résumé
Abstract This study investigates species boundaries in the polyploid complex of Rosa sect. Cinnamomeae east of the Rocky Mountains. This complex is characterized by extensive intra-specific polymorphism that is the consequence, in part, of hybridization and polyploidy. An objective multivariate approach is employed to delimit species in the complex, which involved cluster and ordination analyses of 25 quantitative morphological characters and of amplified fragment length polymorphisms (AFLPs). Because polyploid individuals blurred species boundaries in the complex, they were discriminated a priori using stomata guard cell lengths in order to investigate species boundaries at each ploidy level separately. Four distinct species were found at the diploid level: R. blanda – R. woodsii, R. foliolosa, R. nitida and R. palustris. According to the morphological and molecular data, R. blanda and R. woodsii are indistinguishable and should be considered as a single species. Three species were identified at the polyploid level, R. arkansana, R. carolina, and R. virginiana, albeit with evidence of hybridization between them. The genetic and morphological similarity between individuals of the polyploid species and those of the different diploid species allowed us to identify possible parents for the polyploid species. Rosa arkansana likely originated from R. blanda (incl. R. woodsii), R. carolina from a hybrid between R. blanda and R. palustris, and R. virginiana from R. palustris. Although the multivariate approach was not able to differentiate species when all individuals were considered together, a classification tree showed that it is indeed feasible to identify species in the complex without prior knowledge of the ploidy level of individuals.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».