Abstract 4709: NXF2 is a Candidate Biomarker of Mechanical Stress in Breast Cancer
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Mechanical stress has been implicated as an important factor influencing tumour cell biology. Due to the nature of early stages of breast cancer and its ductal environment and associated stromal changes, origins in ductal changes in gland tension are likely to occur and the associated mechanical forces may contribute to the progression of breast cancer. To identify specific changes in gene expression that might serve as biomarkers of mechanical stress in breast cancer, we applied static tensile forces (0.65 pN/μm2) to breast cancer cell lines via collagen-coated magnetite beads, profiled gene expression changes by Microarray chips, validation by RT-PCR and immunoblotting. Our results showed that mechanical stretch forces altered cell signaling in both MDA-MB-231 and MDA-MB-468 breast cancer cell lines by array chip analysis and 7.24.% genes (4.67% up and 2.57% down regulation) were regulated by mechanical stress in 16822 profiling genes in MDA-MB-231 cell line and 5.79% genes (2.22% up and 3.57% down regulated) was regulated in MDA-MB-468 cell lines. The 0.48% (82/16822) up regulation and the 0.125% (21/16822) down regulation was in complete concordance with Microarray in both cell lines. The validation of the gene expression with significant changes of >1.5-fold in MDA-MB-231 cell line, RT-PCR revealed the up-regulation of LCE2D and NXF2 and down-regulation of PIGH and RAPD1B and confirmed the force-induced genes identified by Microarray. Mechanical stress also increased 2.75 fold NXF2 protein expression level with confirmation of immunoblotting. There were no significant expression changes found relating to hypoxia stress control gene NDRG1, which changed the highest gene in hypoxia control chip. We conclude that mechanical stress promotes early breast cancer progression mediated by multiple signal transduction pathways and that NXF2 is a potential mechanical stress marker in breast cancer progression. Note: This abstract was not presented at the AACR 101st Annual Meeting 2010 because the presenter was unable to attend. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 101st Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2010 Apr 17-21; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2010;70(8 Suppl):Abstract nr 4709.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».