Multiple isoforms of UDP‐glucose pyrophosphorylase in rice
Notice bibliographique
Résumé
Uridine diphosphate (UDP)‐glucose pyrophosphorylases (UGPases, EC 2.7.7.9) are key enzymes in plant carbohydrate metabolism and cell‐wall biosynthesis, catalyzing the reversible production of glucose‐1‐phosphate and uridine triphosphate from UDP‐glucose and pyrophosphate. In the study presented here, two‐dimensional gel electrophoresis followed by peptide sequencing analysis using nanospray electrospray ionization tandem mass spectrometry showed that rice (Oryza sativa L.) UGPase undergoes N‐terminal acetylation, which may be a conserved modification of plant UGPases. We also obtained indications, using two‐dimensional gel electrophoresis in combination with western blot analysis, that multiple isoforms of UGPase are present in rice in vivo and are regulated tissue‐specifically. The rice genome contains two homologous UGPase genes, OsUgp1 and OsUgp2. We present evidence that both OsUgp1 and OsUgp2 are ubiquitously expressed throughout rice development, and that OsUgp1 is expressed at much higher levels than OsUgp2. In accordance with the gene expression patterns, the UGPase isoform derived from the OsUgp1 gene predominated in various rice tissues and exhibited qualitative variations (position shifts and presence/absence) between rice varieties B5 and Taichung native 1 (TN1). Our results demonstrate that these qualitative variations are attributable to a single amino acid substitution of Asp‐462 in B5 by His in TN1, corresponding to the allelic difference in the OsUgp1 gene between B5 and TN1.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».