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Enregistrement W2071774522 · doi:10.1111/j.1399-3054.2007.00865.x

Multiple isoforms of UDP‐glucose pyrophosphorylase in rice

2007· article· en· W2071774522 sur OpenAlexfundno aff
Rongzhi Chen, Xiao Xi Zhao, Zhe Shao, Lili Zhu, Guangcun He

Notice bibliographique

RevuePhysiologia Plantarum · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant nutrient uptake and metabolism
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesWuhan UniversityInstitute of GeneticsNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésUridine diphosphateBiochemistryOryza sativaGene isoformUridine diphosphate glucoseGeneBiologyEnzymeChemistryWestern blotMolecular biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Uridine diphosphate (UDP)‐glucose pyrophosphorylases (UGPases, EC 2.7.7.9) are key enzymes in plant carbohydrate metabolism and cell‐wall biosynthesis, catalyzing the reversible production of glucose‐1‐phosphate and uridine triphosphate from UDP‐glucose and pyrophosphate. In the study presented here, two‐dimensional gel electrophoresis followed by peptide sequencing analysis using nanospray electrospray ionization tandem mass spectrometry showed that rice ( Oryza sativa L.) UGPase undergoes N‐terminal acetylation, which may be a conserved modification of plant UGPases. We also obtained indications, using two‐dimensional gel electrophoresis in combination with western blot analysis, that multiple isoforms of UGPase are present in rice in vivo and are regulated tissue‐specifically. The rice genome contains two homologous UGPase genes, OsUgp1 and OsUgp2 . We present evidence that both OsUgp1 and OsUgp2 are ubiquitously expressed throughout rice development, and that OsUgp1 is expressed at much higher levels than OsUgp2 . In accordance with the gene expression patterns, the UGPase isoform derived from the OsUgp1 gene predominated in various rice tissues and exhibited qualitative variations (position shifts and presence/absence) between rice varieties B5 and Taichung native 1 (TN1). Our results demonstrate that these qualitative variations are attributable to a single amino acid substitution of Asp‐462 in B5 by His in TN1, corresponding to the allelic difference in the OsUgp1 gene between B5 and TN1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,683
Score d'incertitude au seuil0,237

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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