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Enregistrement W2072370732 · doi:10.1371/journal.pone.0024937

Notch3 Is Dispensable for Thymocyte β-Selection and Notch1-Induced T Cell Leukemogenesis

2011· article· en· W2072370732 sur OpenAlexafffund
Sara Suliman, Joanne B.L. Tan, Keli Xu, Philaretos C. Kousis, Paul E. Kowalski, Greg Chang, Sean E. Egan, Cynthia J. Guidos

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDevelopmental Biology and Gene Regulation
Établissements canadiensUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesOntario Genomics InstituteCanadian Institutes of Health ResearchGenome CanadaOntario GenomicsVanderbilt-Ingram Cancer CenterHospital for Sick ChildrenVanderbilt University
Mots-clésThymocyteT cellBiologyLigand (biochemistry)Progenitor cellCell biologyCD8Double negativeLymphopoiesisNegative selectionReceptorStem cellGeneticsImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Notch1 (N1) signaling induced by intrathymic Delta-like (DL) ligands is required for T cell lineage commitment as well as self-renewal during "β-selection" of TCRβ⁺CD4⁻CD8⁻ double negative 3 (DN3) T cell progenitors. However, over-expression of the N1 intracellular domain (ICN1) renders N1 activation ligand-independent and drives leukemic transformation during β-selection. DN3 progenitors also express Notch3 (N3) mRNA, and over-expression of ligand-independent mutant N3 (ICN3) influences β-selection and drives T cell leukemogenesis. However, the importance of ligand-activated N3 in promoting β-selection and ICN1-induced T cell leukemogenesis has not been examined. To address these questions we generated mice lacking functional N3. We confirmed that DN3 progenitors express N3 protein using a N3-specific antibody. Surprisingly however, N3-deficient DN3 thymocytes were not defective in generating DP thymocytes under steady state conditions or in more stringent competition assays. To determine if N3 co-operates with N1 to regulate β-selection, we generated N1;N3 compound mutants. However, N3 deficiency did not exacerbate the competitive defect of N1⁺/⁻ DN3 progenitors, demonstrating that N3 does not compensate for limiting N1 during T cell development. Finally, N3 deficiency did not attenuate T cell leukemogenesis induced by conditional expression of ICN1 in DN3 thymocytes. Importantly, we showed that in contrast to N1, N3 has a low binding affinity for DL4, the most abundant intrathymic DL ligand. Thus, despite the profound effects of ectopic ligand-independent N3 activation on T cell development and leukemogenesis, physiologically activated N3 is dispensable for both processes, likely because N3 interacts poorly with intrathymic DL4.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,419

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,159 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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