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Enregistrement W2072533743 · doi:10.2135/cropsci2013.06.0391

Genetic Study and QTL Mapping of Seed Glucosinolate Content in <i>Brassica rapa</i> L.

2014· article· en· W2072533743 sur OpenAlexafffund
Habibur Rahman, Berisso Kebede, Céline Zimmerli, Rong‐Cai Yang

Notice bibliographique

RevueCrop Science · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics, phytochemicals, and oxidative stress
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesGenome AlbertaGenome Canada
Mots-clésQuantitative trait locusBiologyBrassica rapaGeneticsGenetic variationInbred strainGlucosinolateOverdominancePopulationDominance (genetics)Genetic analysisAlleleBrassicaGeneBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Self‐incompatibility in Brassica rapa L. is a major impediment to experimental studies on the genetic control of quantitative traits such as seed glucosinolate (GSL) content. In this paper, we report quantitative trait loci (QTL) mapping of total seed GSL content using a recombinant inbred line (RIL) population derived from two self‐compatible high‐ and low‐GSL B. rapa grown under different environmental conditions. Furthermore, quantitative genetic analysis using the parents and their F 1 , F 2 , B 1 (F 1 backcrossed to high‐parent P 1 ), B 2 (F 1 backcrossed to low‐parent P 2 ), and self‐pollinated progenies of B 1 generation populations are also reported. Quantitative genetic analysis showed that additive genetic variance was consistently significant under different environments, while the dominance effect was significant under one growth condition. However, a simple additive‐dominance model was inadequate to explain the segregation variation among the generation means. Nonallelic interaction effects were important in the genetic control of GSL content in early generations where the levels of heterozygosity remained high. QTL mapping detected three loci at the linkage groups A2, A7, and A9 involved in the control of this trait. These QTL individually explained 5 to 22% of total phenotypic variation. The QTL on A9 was detected in all environments and explained 22%, the greatest amount of phenotypic variation. No additive × additive gene interaction was detected based on QTL analysis, and this also largely agreed with quantitative genetic analysis. Similarly, the number of loci detected based on QTL mapping also agree with the results obtained from quantitative genetic analysis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,238
Score d'incertitude au seuil0,351

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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