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Enregistrement W2072762874 · doi:10.1385/1-59259-058-6:47

Synthesis of Chemokines

2003· article· en· W2072762874 sur OpenAlexaff
Ian Clark‐Lewis

Notice bibliographique

RevueHumana Press eBooks · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChemokine receptors and signaling
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesMedical Research Council
Mots-clésChemokineDNAComputational biologyRecombinant DNAChemistryComplementary DNASolid-phase synthesisBiologyMolecular biologyPeptideBiochemistryGeneReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Solid phase peptide synthesis (SPPS) is an alternative to DNA expression for generating proteins, such as chemokines (1–1). DNA databases and cDNA cloning has resulted in an explosion in the number of new chemokines from 1995-1998. However, for studies of the protein, knowing the DNA sequence is only the first step. The chemokine must be generated and in its correctly processed and folded form, and then purified to homogeneity. Expression of the cDNA is the popular route to the protein; however, de novo chemical synthesis has some significant advantages (e.g., efficient SPPS can provide 10-100 mg of pure chemokine in only a few days). Chemically synthesized chemokines have the same three-dimensional structures as ribosome-assembled chemokines made by recombinant DNA expression (3–5,7,9,10). Functionally, they are indistinguishable. The cumulative results of our chemokine studies have shown that chemical synthesis is a straightforward route to chemokines and their analogs. In this chapter, I describe the principles and procedures that colleagues and I have developed for synthesis of chemokines (1–11). Despite many advantages (see Subheading 1.1., step 1–10), peptide synthesis has not been widely applied to proteins. One reason is that most researchers approach proteins from a biological, rather than a chemical, standpoint. Another is that in the early days of SPPS, the methods were limited to short peptides. However, gradual optimization of the chemistry eventually led to the synthesis of small proteins (12–14). Although the individual steps involved are straightforward, the methods require hands-on experience and a firm understanding of the principles involved.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,586
Score d'incertitude au seuil0,329

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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