Identification of Novel Cholesterol-binding Regions in Kir2 Channels
Notice bibliographique
Résumé
Inwardly rectifying potassium (Kir) channels play an important role in setting the resting membrane potential and modulating membrane excitability. We have recently shown that cholesterol regulates representative members of the Kir family and that in the majority of the cases, cholesterol suppresses channel function. Furthermore, recent data indicate that cholesterol regulates Kir channels by specific sterol-protein interactions, yet the location of the cholesterol binding site in Kir channels is unknown. Using a combined computational-experimental approach, we show that cholesterol may bind to two nonanular hydrophobic regions in the transmembrane domain of Kir2.1 located between adjacent subunits of the channel. The location of the binding regions suggests that cholesterol modulates channel function by affecting the hinging motion at the center of the pore-lining transmembrane helix that underlies channel gating either directly or through the interface between the N and C termini of the channel.Background: Cholesterol modulates inwardly rectifying potassium (Kir) channels.Results: Using a combined computational-experimental approach, we identified two putative cholesterol-binding regions in Kir2.1 that suggest the existence of a novel cholesterol binding motif.Conclusion: Cholesterol binds to nonannular surfaces in the transmembrane domain of Kir2.1.Significance: These findings provide new insights into the mechanisms underlying lipid regulation of ion channels. Inwardly rectifying potassium (Kir) channels play an important role in setting the resting membrane potential and modulating membrane excitability. We have recently shown that cholesterol regulates representative members of the Kir family and that in the majority of the cases, cholesterol suppresses channel function. Furthermore, recent data indicate that cholesterol regulates Kir channels by specific sterol-protein interactions, yet the location of the cholesterol binding site in Kir channels is unknown. Using a combined computational-experimental approach, we show that cholesterol may bind to two nonanular hydrophobic regions in the transmembrane domain of Kir2.1 located between adjacent subunits of the channel. The location of the binding regions suggests that cholesterol modulates channel function by affecting the hinging motion at the center of the pore-lining transmembrane helix that underlies channel gating either directly or through the interface between the N and C termini of the channel. Background: Cholesterol modulates inwardly rectifying potassium (Kir) channels. Results: Using a combined computational-experimental approach, we identified two putative cholesterol-binding regions in Kir2.1 that suggest the existence of a novel cholesterol binding motif. Conclusion: Cholesterol binds to nonannular surfaces in the transmembrane domain of Kir2.1. Significance: These findings provide new insights into the mechanisms underlying lipid regulation of ion channels.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».