MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2073356926 · doi:10.1139/b09-005

Compartmental cross-talk in the regulation of light harvesting complex transcription under short-term light and temperature stress in <i>Chlamydomonas reinhardtii</i>

2009· article· en· W2073356926 sur OpenAlexaffvenue
Penny L. Humby, Michelle L. Cunningham, Holly Saunders, Julie Price, Dion G. Durnford

Notice bibliographique

RevueBotany · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChlamydomonas reinhardtiiBiologyPlastoquinoneChlamydomonasChloroplastCell biologyPlastidPhotosynthesisTranscription (linguistics)Transcription factorBotanyBiochemistryThylakoidGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Short-term light stress in Chlamydomonas leads to transient changes in light harvesting complex (LHC) transcription. This requires cross-talk between the plastid and nucleus to coordinate chloroplast function with nuclear transcription. None of the components of this signalling pathway have been identified although several sensor candidates have been proposed. To examine the regulation of nuclear photosynthetic gene expression, we constructed an LHC::Arylsulphatase (ARS) reporter system in Chlamydomonas reinhardtii allowing us to examine short-term regulatory changes on a fine scale. We modulated plastoquinone (PQ) redox state via photosynthetic inhibitors, changes in light and (or) temperature and found no evidence that either the PQ pool or Q A redox state were directly involved in short-term retrograde signalling. Shifts in light level and (or) temperature indicated that LHC transcriptional activity is tightly coordinated to photosynthetic production. Transient switching between photoautotrophic and mixotrophic growth, plus the use of mitochondrial inhibitors indicated that nuclear photosynthetic gene expression is coupled to mitochondrial activity. These short-term effects on LHC transcription demonstrate an interdependence of photosynthetic production and mitochondrial activity, suggesting Chlamydomonas is able to respond to environmental changes by monitoring metabolite pools between the chloroplast and mitochondria and not in the chloroplast directly.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,143
Score d'incertitude au seuil0,406

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBotanyMême sujetPhotosynthetic Processes and MechanismsTravaux en français237 207