Isozymes of the Isoetes riparia Complex, II. Ancestry and Relationships of Polyploids
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Isoetes riparia is a complex tetraploid taxon of eastern North America that in its widest sense includes a diversity of morphotypes variously segregated, or included in a single polymorphic species. Although the diploid ancestry of I. riparia has been proposed as I. echinospora × engelmannii, it is uncertain whether this ancestry applies to all elements of the complex, here broadly defined to encompass three segregates of I. riparia and the recently described I. hyemalis (referred to informally as riparia, canadensis, saccharata and hyemalis). To help clarify relationships among these tetraploids, isozyme genotypes for 13 loci coding eight enzymes, were determined for 16 populations representing all four segregates. Duplicate gene expression, evidenced as fixed heterozygosity consistent with allopolyploidy, characterized the tetraploid genotypes of all taxa. Although exhibiting modest to no variation within populations, populations were highly differentiated, most showing a unique combination of alleles for their multilocus genotypes, with the exception of five genetically identical Canadian populations. Ancestry was evaluated through comparison to diploid genotypes previously reported. A quantitative approach was carried out to rank likelihoods for hypothetical ancestral combinations of diploids for each tetraploid population. The ancestry I. echinospora × engelmannii hypothesized for I. riparia was unequivocally supported for the six populations of the most northern segregate, canadensis. Diploid ancestries for the remaining 10 more southern populations were less certain, although the diploid I. mattaponi was implicated as a likely ancestor for most. Most likely ancestry for populations of riparia/saccharata was inferred as I. valida × mattaponi, and for hyemalis as I. mattaponi × flaccida. However, these hypotheses were only slightly more likely than other combinations. UPGMA analysis using Rogers' similarity resulted in three clusters corresponding to canadensis, riparia/saccharata, and hyemalis. However, the hyemalis cluster was weakly associated and was not supported by UPGMA using Nei's identity. These highly variable tetraploid genotypes suggest a complicated evolutionary history for the I. riparia complex that probably involved a combination of diverse ancestry, multiple origins, divergence, and gene silencing. Communicating Editor: Anita Cholewa
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».