A membrane-bound glycerol-3-phosphate acyltransferase from<i>Thalassiosira pseudonana</i>regulates acyl composition of glycerolipidsThis paper is one of a selection of papers published in a Special Issue from the National Research Council of Canada – Plant Biotechnology Institute.
Notice bibliographique
Résumé
To what extent fatty acyltransferases control fatty acid composition in glycerolipids is largely unknown. To gain some insight into this process, we characterized a membrane-bound glycerol-3-phosphate acyltransferase (GPAT), designated TpGPAT, from the marine diatom Thalassiosira pseudonana Hasle & Heim. The glycerolipids from T. pseudonana consist predominantly of 16:0, 16:1ω7, and 20:5ω3 fatty acids. Heterologous expression of TpGPAT in a yeast GPAT-deficient mutant (gat1) demonstrated that TpGPAT could effectively use glycerol-3-phosphate, but not dihydroxyacetone phosphate, as fatty acyl acceptor. This enzyme highly preferred 16:0 in an in vitro enzyme assay, and discriminated against the monounsaturated 16-carbon fatty acid. Accordingly, expression of TpGPAT in gat1 resulted in approximately 18% and 12% increases of 16:0 in triacylglycerols and phospholipids, respectively. The unsaturated fatty acids, 16:1 and 18:1, on the other hand, were reduced by 15% and 21% in these two lipid species. Collectively, the results demonstrate that TpGPAT possesses a high substrate preference for 16:0-CoA and it exerts a large effect on the fatty-acid composition of glycerolipids.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».