MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2074622472 · doi:10.1002/pbc.24191

Expression and stability of hypoxia inducible factor 1α in osteosarcoma

2012· article· en· W2074622472 sur OpenAlexaff
Amal M. El-Naggar, Paul W. Clarkson, Fan Zhang, Joan Mathers, Cristina E. Tognon, Poul H. Sorensen

Notice bibliographique

RevuePediatric Blood & Cancer · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesU.S. Department of Defense
Mots-clésOsteosarcomaHypoxia (environmental)Transcription factorCancer researchCell cultureImmunohistochemistryMedicineHypoxia-inducible factorsCellPathologyBiologyChemistryGeneOxygenBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Hypoxia contributes to both physiological and pathological processes and its effects are mainly mediated through the transcription factors hypoxia-inducible factor 1α and 2α (HIF1α and HIF2α). The purpose of this study was to examine the role of these proteins in osteosarcoma progression. PROCEDURES: We developed a method to isolate primary human osteoblast cell lines. HIF1α and HIF2α expression were then compared in osteoblast and osteosarcoma cell lines under 21% oxygen (normoxia) and 1% oxygen (hypoxia). We also used hypoxia-responsive element (HRE)-driven reporter constructs in conjunction with siRNAs specific to HIF1α or HIF2α to determine the contribution of each protein to HRE-mediated transcription. Finally, we measured HIF1α expression in primary osteosarcoma tumors by immunohistochemistry. RESULTS: We found that mainly HIF1α transcript was significantly higher in osteosarcoma cell lines compared to normal osteoblasts under both normoxia and hypoxia. At the protein level, HIF1α was preferentially stabilized in osteosarcoma cell lines under both conditions. HIF1α expression was required for the observed increases in HRE activity. Finally, nuclear or nucleocytoplasmic HIF1α staining in osteosarcoma cases was associated with high-grade tumors. CONCLUSIONS: These findings point to a role for HIF1α in osteosarcoma progression and suggest that the observed differences in HIF1α oxygen dependent degradation may play an important pathophysiological role in this disease. Pediatr Blood Cancer 2012; 59: 1215-1222. © 2012 Wiley Periodicals, Inc.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,083
Score d'incertitude au seuil0,544

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePediatric Blood & CancerMême sujetCancer, Hypoxia, and MetabolismTravaux en français237 207