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Enregistrement W2074792363 · doi:10.1074/jbc.m113.491829

Peptidoglycan ld-Carboxypeptidase Pgp2 Influences Campylobacter jejuni Helical Cell Shape and Pathogenic Properties and Provides the Substrate for the dl-Carboxypeptidase Pgp1

2014· article· en· W2074792363 sur OpenAlexafffund
Emilisa Frirdich, Jenny Vermeulen, Jacob Biboy, Fraser Soares, Michael E. Taveirne, Jeremiah G. Johnson, Victor J. DiRita, Stephen E. Girardin, Waldemar Vollmer, Erin C. Gaynor

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésPeptidoglycanTripeptideCampylobacter jejuniMutantCarboxypeptidaseBiochemistryMicrobiologyBiologyChemistryCell wallEnzymeAmino acidBacteriaGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Despite the importance of Campylobacter jejuni as a pathogen, little is known about the fundamental aspects of its peptidoglycan (PG) structure and factors modulating its helical morphology. A PG dl-carboxypeptidase Pgp1 essential for maintenance of C. jejuni helical shape was recently identified. Bioinformatic analysis revealed the CJJ81176_0915 gene product as co-occurring with Pgp1 in several organisms. Deletion of cjj81176_0915 (renamed pgp2) resulted in straight morphology, representing the second C. jejuni gene affecting cell shape. The PG structure of a Δpgp2 mutant showed an increase in tetrapeptide-containing muropeptides and a complete absence of tripeptides, consistent with ld-carboxypeptidase activity, which was confirmed biochemically. PG analysis of a Δpgp1Δpgp2 double mutant demonstrated that Pgp2 activity is required to generate the tripeptide substrate for Pgp1. Loss of pgp2 affected several pathogenic properties; the deletion strain was defective for motility in semisolid agar, biofilm formation, and fluorescence on calcofluor white. Δpgp2 PG also caused decreased stimulation of the human nucleotide-binding oligomerization domain 1 (Nod1) proinflammatory mediator in comparison with wild type, as expected from the reduction in muropeptide tripeptides (the primary Nod1 agonist) in the mutant; however, these changes did not alter the ability of the Δpgp2 mutant strain to survive within human epithelial cells or to elicit secretion of IL-8 from epithelial cells after infection. The pgp2 mutant also showed significantly reduced fitness in a chick colonization model. Collectively, these analyses enhance our understanding of C. jejuni PG maturation and help to clarify how PG structure and cell shape impact pathogenic attributes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,179 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations84
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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