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Enregistrement W2074952917 · doi:10.1021/bi0511179

Interaction of LDS-751 and Rhodamine 123 with P-Glycoprotein:  Evidence for Simultaneous Binding of Both Drugs

2005· article· en· W2074952917 sur OpenAlexaff
Miguel R. Lugo, Frances J. Sharom

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug Transport and Resistance Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBinding siteRhodamine 123ChemistryRhodamineStereochemistryBiochemistryATP-binding cassette transporterPlasma protein bindingP-glycoproteinBiophysicsTransporterFluorescenceBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The P-glycoprotein efflux pump, an ABC superfamily member, can export a wide variety of hydrophobic drugs, natural products, and peptides from cells, powered by the energy of ATP hydrolysis. Transport substrates appear to first partition into the membrane and then interact with the protein within the cytoplasmic leaflet. Two drug binding sites within P-glycoprotein have been described which interact allosterically, the H-site (binds Hoechst 33342) and the R-site (binds rhodamine 123); however, the structural and functional relationship between the various binding sites appears complex. In this work, we have used fluorescence spectroscopic approaches to characterize the interaction of the transporter with LDS-751 and rhodamine 123, both of which are believed to bind to the putative R-site based on functional transport studies. By carrying out single and sequential dual fluorescence titrations of purified P-glycoprotein with the two substrates, we observed that bound LDS-751 interacted with bound rhodamine 123. Rhodamine 123 and LDS-751 showed a reciprocal negative interaction, each reducing the binding affinity of the other by 5-fold, indicating that the two compounds were simultaneously bound to the protein to form a ternary complex. Fitting of the dependence of the apparent Kd for LDS-751 binding on rhodamine 123 concentration suggested that the two compounds interacted noncompetitively. We conclude that the two-site drug binding model for P-glycoprotein requires modification. The putative R-site appears large enough to accommodate two compounds simultaneously. The locations where LDS-751 and rhodamine 123 bind are likely adjacent to each other, possibly overlapping, and may be within a hydrophobic pocket.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,339

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations83
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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