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Enregistrement W2075068616 · doi:10.1093/protein/gzg091

Precise and efficient cleavage of recombinant fusion proteins using mammalian aspartic proteases

2003· article· en· W2075068616 sur OpenAlexaff
Brigitte Kühnel, Joenel Alcantara, James H. Boothe, G. van Rooijen, Maurice M. Moloney

Notice bibliographique

RevueProtein Engineering Design and Selection · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMonoclonal and Polyclonal Antibodies Research
Établissements canadiensSembiosys Genetics (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRecombinant DNAFusion proteinTobacco etch virusBiochemistryThioredoxinEscherichia coliCleavage (geology)EnteropeptidaseChemistryFLAG-tagMyc-tagCystatinProtein tagProteaseProteasesTandem affinity purificationPeptideTarget peptideBiologyAffinity chromatographyEnzymeCystatin CGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Expression of recombinant proteins as translational fusions is commonly employed to enhance stability, increase solubility and facilitate purification of the desired protein. In general, such fusion proteins must be cleaved to release the mature protein in its native form. The usefulness of the procedure depends on the efficiency and precision of cleavage and its cost per unit activity. We report here the development of a general procedure for precise and highly efficient cleavage of recombinant fusion proteins using the protease chymosin. DNA encoding a modified pro-peptide from bovine chymosin was fused upstream of hirudin, carp growth hormone, thioredoxin and cystatin coding sequences and expressed in a bacterial Escherichia coli host. Each of the resulting fusion proteins was efficiently cleaved at the junction between the pro-peptide and the desired protein by the addition of chymosin, as determined by activity, N-terminal sequencing and mass spectrometry of the recovered protein. The system was tested further by cleavage of two fusion proteins, cystatin and thioredoxin, sequestered on oilbody particles obtained from transgenic Arabidopsis seeds. Even when the fusion protein was sequestered and immobilized on oilbodies, precise and efficient cleavage was obtained. The precision, efficiency and low cost of this procedure suggest that it could be used in larger scale manufacturing of recombinant proteins which benefit from expression as fusions in their host organism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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