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Enregistrement W2075235600 · doi:10.1242/jcs.042531

Knockout of GARPs and the β-subunit of the rod cGMP-gated channel disrupts disk morphogenesis and rod outer segment structural integrity

2009· article· en· W2075235600 sur OpenAlexaff
Youwen Zhang, Laurie L. Molday, Robert S. Molday, Shanta Sarfare, Michael L. Woodruff, Gordon Fain, Timothy W. Kraft, Steven J. Pittler

Notice bibliographique

RevueJournal of Cell Science · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Eye Institute
Mots-clésHomomericBiologyProtein subunitCell biologyVisual phototransductionMorphogenesisBiophysicsBiochemistryRetinalGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ion flow into the rod photoreceptor outer segment (ROS) is regulated by a member of the cyclic-nucleotide-gated cation-channel family; this channel consists of two subunit types, alpha and beta. In the rod cells, the Cngb1 locus encodes the channel beta-subunit and two related glutamic-acid-rich proteins (GARPs). Despite intensive research, it is still unclear why the beta-subunit and GARPs are coexpressed and what function these proteins serve. We hypothesized a role for the proteins in the maintenance of ROS structural integrity. To test this hypothesis, we created a Cngb1 5'-knockout photoreceptor null (Cngb1-X1). Morphologically, ROSs were shorter and, in most rods that were examined, some disks were misaligned, misshapen and abnormally elongated at periods when stratification was still apparent and degeneration was limited. Additionally, a marked reduction in the level of channel alpha-subunit, guanylate cyclase I (GC1) and ATP-binding cassette transporter (ABCA4) was observed without affecting levels of other ROS proteins, consistent with a requirement for the beta-subunit in channel assembly or targeting of select proteins to ROS. Remarkably, phototransduction still occurred when only trace levels of homomeric alpha-subunit channels were present, although rod sensitivity and response amplitude were both substantially reduced. Our results demonstrate that the beta-subunit and GARPs are necessary not only to maintain ROS structural integrity but also for normal disk morphogenesis, and that the beta-subunit is required for normal light sensitivity of the rods.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations86
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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