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Enregistrement W2075394688 · doi:10.1002/ejoc.201200397

Fluorinated Carbohydrates as Lectin Ligands: Biorelevant Sensors with Capacity to Monitor Anomer Affinity in <sup>19</sup>F‐NMR‐Based Inhibitor Screening

2012· article· en· W2075394688 sur OpenAlexaff
Sabine André, F. Javier Cañada, Tze Chieh Shiao, Laura Largartera, Tammo Diercks, Milan Bergeron‐Brlek, Khouzaima El Biari, Alex Papadopoulos, João P. Ribeiro, Mohamed Touaibia, Dolores Solı́s, Margarita Menéndez, Jesús Jiménez‐Barbero, René Roy, Hans‐Joachim Gabius

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Organic Chemistry · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueCarbohydrate Chemistry and Synthesis
Établissements canadiensUniversité de MonctonUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryAnomerLectinStereochemistryNuclear magnetic resonance spectroscopyDocking (animal)Two-dimensional nuclear magnetic resonance spectroscopyMannoseCombinatorial chemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Our recent description of pulse sequences for the intramolecular relay of 1 H polarization to the 19 F reporter of a carbohydrate ligand after saturation transfer from a cognate lectin prompted us to test the applicability of this technique for inhibitor screening. By strategically combining synthetic organic chemistry and cell assays with 19 F‐NMR‐based competition experiments, we document the validity of this approach. Two mannose‐specific leguminous agglutinins as receptors, the α‐methyl derivative of 2‐deoxy‐2‐fluoro‐ D ‐mannopyranoside as sensor and synthetic mannosides selected to represent different inhibitory capacities were used to establish a test panel. Signal amplitudes were found to vary among the two related lectins, and their precipitation by glycodendrimers enabled inherent limits to be set. The obtained experimental basis was then broadened by assaying a galactopyranoside‐binding plant toxin, using 6‐deoxy‐6‐fluoro‐ D ‐galactopyranose as a sensor molecule. The easy identification of the two anomeric signals by 19 F NMR spectroscopy enabled ready detection of the preference of this lectin for the α‐anomer and allowed the two individual inhibition profiles to be deduced. These 19 F NMR spectroscopic data were in accord with the activities of inhibitors used to protect cells from toxicity. Our results therefore provide an experimental basis for 19 F‐NMR‐based inhibitor screening.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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