MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2075428157 · doi:10.1371/journal.ppat.1002468

Human Subtilase SKI-1/S1P Is a Master Regulator of the HCV Lifecycle and a Potential Host Cell Target for Developing Indirect-Acting Antiviral Agents

2012· article· en· W2075428157 sur OpenAlexafffund
Andrea D. Olmstead, Wolfgang Knecht, Ina Lazarov, Surjit B. Dixit, François Jean

Notice bibliographique

RevuePLoS Pathogens · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis C virus research
Établissements canadiensZymeworks (Canada)University of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMichael Smith Health Research BC
Mots-clésBiologySterol regulatory element-binding proteinCell biologyHepatitis C virusLipid dropletViral replicationLipid metabolismVirologyVirusTranscription factorBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

HCV infection is a major risk factor for liver cancer and liver transplantation worldwide. Overstimulation of host lipid metabolism in the liver by HCV-encoded proteins during viral infection creates a favorable environment for virus propagation and pathogenesis. In this study, we hypothesize that targeting cellular enzymes acting as master regulators of lipid homeostasis could represent a powerful approach to developing a novel class of broad-spectrum antivirals against infection associated with human Flaviviridae viruses such as hepatitis C virus (HCV), whose assembly and pathogenesis depend on interaction with lipid droplets (LDs). One such master regulator of cholesterol metabolic pathways is the host subtilisin/kexin-isozyme-1 (SKI-1)--or site-1 protease (S1P). SKI-1/S1P plays a critical role in the proteolytic activation of sterol regulatory element binding proteins (SREBPs), which control expression of the key enzymes of cholesterol and fatty-acid biosynthesis. Here we report the development of a SKI-1/S1P-specific protein-based inhibitor and its application to blocking the SREBP signaling cascade. We demonstrate that SKI-1/S1P inhibition effectively blocks HCV from establishing infection in hepatoma cells. The inhibitory mechanism is associated with a dramatic reduction in the abundance of neutral lipids, LDs, and the LD marker: adipose differentiation-related protein (ADRP)/perilipin 2. Reduction of LD formation inhibits virus assembly from infected cells. Importantly, we confirm that SKI-1/S1P is a key host factor for HCV infection by using a specific active, site-directed, small-molecule inhibitor of SKI-1/S1P: PF-429242. Our studies identify SKI-1/S1P as both a novel regulator of the HCV lifecycle and as a potential host-directed therapeutic target against HCV infection and liver steatosis. With identification of an increasing number of human viruses that use host LDs for infection, our results suggest that SKI-1/S1P inhibitors may allow development of novel broad-spectrum biopharmaceuticals that could lead to novel indirect-acting antiviral options with the current standard of care.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,226
Score d'incertitude au seuil0,578

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,070
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations78
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS PathogensMême sujetHepatitis C virus researchTravaux en français237 207