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Enregistrement W2075495560 · doi:10.1021/bi000282f

Preferential Oxidation of Zinc Finger 2 in Estrogen Receptor DNA-binding Domain Prevents Dimerization and, Hence, DNA Binding

2000· article· en· W2075495560 sur OpenAlexfundno aff
Randy M. Whittal, Christopher C. Benz, Gary K. Scott, Jenia Semyonov, Alma L. Burlingame, Michael A. Baldwin

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA and Nucleic Acid Chemistry
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Center for Research ResourcesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésChemistryZinc fingerCircular dichroismDithiothreitolCysteineEstrogen receptorDNADNA-binding domainElectrophoretic mobility shift assayRecombinant DNABiochemistryBiophysicsBiologyEnzymeTranscription factorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

For approximately one-third of estrogen receptor (ER)-positive breast cancer patients, extracted tumor ER is unable to bind to its cognate DNA estrogen response element (ERE), an effect that is partly reversible by the thiol-reducing agent dithiothreitol (DTT). Full-length (67 kDa) ER or its 11 kDa recombinant DNA-binding domain (ER-DBD) is also susceptible to loss of structure and function by the action of oxidants such as diamide and hydrogen peroxide; however, prior DNA binding by ER or ER-DBD protects against this oxidant induced loss of function. The ER-DBD contains two (Cys)(4)-liganded zinc finger motifs that cooperate to stabilize a rigid DNA-binding recognition helix and a flexible helix-supported dimerization loop, respectively. Comparisons between synthetic peptide analogues of each zinc finger and recombinant ER-DBD in the presence of zinc by electrophoretic mobility shift assay, circular dichroism, and mass spectrometry confirm that cooperativity between these zinc fingers is required for both ER-DBD structure (alpha-helicity) and function (dimeric DNA binding). Rapid proteolytic digestion of monomeric, non-DNA-bound ER-DBD followed by HPLC-MS analysis of the resulting peptides demonstrates that zinc inhibits thiol oxidation of the DNA-binding finger, but not the finger supporting the flexible dimerization loop, which remains sensitive to internal disulfide formation. These findings indicate that the loss of ER DNA-binding function in extracts from some primary breast tumors and in ER or ER-DBD exposed to thiol-reacting oxidants results from this asymmetric zinc finger susceptibility to disulfide formation that prevents dimerization. Although ER-DBD contains several strategically located methionine residues, they are less susceptible to oxidation than the thiol groups and, thus, afford no protection against cysteine oxidation and consequent loss of ER DNA-binding function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,896

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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