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Enregistrement W2075499568 · doi:10.1139/w02-053

Regulation of indoleacetic acid production in<i>Pseudomonas putida</i>GR12-2 by tryptophan and the stationary-phase sigma factor RpoS

2002· article· en· W2075499568 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésrpoSPseudomonas putidaSigma factorBiologyBiochemistryTryptophanPromoterPlasmidMolecular biologyMicrobiologyEnzymeGene expressionGeneAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The phytohormone indole-3-acetic acid (IAA) accumulates in the culture medium of the plant growth-promoting bacterium Pseudomonas putida GR12-2 only when grown in the presence of exogenous tryptophan, suggesting that expression of indolepyruvate decarboxylase, a key enzyme in the IAA biosynthesis pathway in this bacterium, may be regulated by tryptophan. To test this hypothesis, we isolated the promoter region for the ipdc gene encoding indolepyruvate decarboxylase by inverse polymerase chain reaction (PCR) and inserted it upstream of the bioluminescent reporter gene luxAB on a plasmid in P. putida GR12-2. Activity of the ipdc promoter, measured by quantifying light production, increased fivefold in the presence of L-tryptophan, confirming that ipdc expression is induced by tryptophan. In addition, transcription of ipdc is regulated by the stationary phase sigma factor RpoS: the ipdc promoter contains a sequence similar to the RpoS recognition sequence, and transformation of P. putida GR12-2 with a plasmid carrying rpoS under the control of a constitutive promoter induced promoter activity before the onset of stationary phase when RpoS is not normally produced and prolonged a higher level of transcription at the later stages of the cell cycle.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,250
Score d'incertitude au seuil0,612

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle