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Enregistrement W2075582785 · doi:10.1109/hpcsim.2014.6903679

Porting a neuro-imaging application to a CPU-GPU cluster

2014· article· en· W2075582785 sur OpenAlex
Reza Nakhjavani, Sahel Sharify, Ali Hashemi, Alan Wen Jun Lu, Cristiana Amza, Stephen C. Strother

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueDistributed and Parallel Computing Systems
Établissements canadiensBaycrest HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComputer scienceSpeedupGPU clusterPortingParallel computingScheduling (production processes)Job shop schedulingSupercomputerCluster (spacecraft)CUDASoftwareOperating system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ever increasing complexity of scientific applications has led to utilization of new HPC paradigms such as Graphical Processing Units (GPUs). However, modifying existing applications to enable them to be executed on GPU can be challenging. Furthermore, the considerable speedup achieved by execution of linear algebra operations on GPUs has added a huge heterogeneity to HPC clusters. In this work, we enabled NPAIRS, a neuro-imaging application, to be executed on GPU with slight modifications to its original code. This important feature of our implementation enables current users of NPAIRS, i.e. non-expert bio-medical scientists, to get benefit from GPU without having to apply fundamental changes to their existing application. As the second part of our research, we investigated the efficiency of several scheduling algorithms for a heterogeneous cluster that contains GPU nodes. Experimental results show that we achieved 7× speedup for NPAIRS. Moreover, although scheduling does not play an important role when there is no GPU node in the cluster, it can highly improve the makespan for a CPU-GPU cluster. We compared our scheduling results with Torque and MCT, two of the most commonly used schedulers in current HPC platforms. Our results show that the Sufferage scheduling can improve the makespan of Torque and MCT by 47% and 4% respectively.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,967
Score d'incertitude au seuil0,461

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

En bref

Citations1
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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