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Enregistrement W2075814595 · doi:10.1186/1741-7007-11-51

Q&A: Antibiotic resistance: what more do we know and what more can we do?

2013· article· en· W2075814595 sur OpenAlexafffundabout
Gerard D. Wright

Notice bibliographique

RevueBMC Biology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyAntibiotic resistanceAntibioticsResistance (ecology)MicrobiologyComputational biologyEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Is the problem of antibiotic resistance getting worse? Yes. Resistance to antibiotics continues to be a significant and growing medical problem across the globe. In the US, the Centers for Disease Control recently released a report showing that infections due to carbapenemresistant Enterobacteriaceae (CRE), which are associated with mortality rates between 40% and 50%, rose from 1.2% to 4.2% over the decade from 2001 to 2011 [1]. In the clinically important Klebsiella subset of these pathogens, the rise over the same time period was from 1.6% to 10.4%. Carbapenems are among the last resort antibiotics we have to treat infections of Gramnegative bacteria and this steady erosion of their efficacy is especially concerning. The cause is the spread of genes that encode enzymes that destroy these antibiotics, in particular KPC (Klebsiella pneumoniae carbapenemase) and NDM (New Delhi metallo-betalactamase) [2]. The latter has been found widespread in the environment, including the water supply on the Indian subcontinent [3]. Infections due to multidrug resistant Neisseria gonorrhea are also on the rise. Once easily treated with available antibiotics, the emergence of drug-resistant strains resulting in clinical failures is becoming more common. A recent study in a Toronto clinic showed that 6.77% of cases could not be cured with standard oral antibiotic therapy [4]. Outbreaks of infections caused by multidrug and sometimes pan-resistant epidemic clones of Acinetobacter baumannii are increasingly reported in health care settings across the globe. The establishment of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) in the community at large as well as in hospitals is continuing; over 460,000 MRSA infections required hospitalization in the US in 2009 [5]. There are now circulating

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,015
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,051
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,095
Score d'incertitude au seuil0,317

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0150,051
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0040,009
Communication savante0,0150,020
Science ouverte0,0040,006
Intégrité de la recherche0,0170,019
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0950,052

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2013
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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