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Enregistrement W2075900076 · doi:10.1094/pdis.2002.86.12.1396

Biplot Analysis of Host-by-Pathogen Data

2002· article· en· W2075900076 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGenetics and Plant Breeding
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiplotGenotypeBiologyHost (biology)PathogenStrain (injury)VirulenceGeneticsComputational biologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Effective breeding for disease resistance relies on a thorough understanding of host-by-pathogen relations. Achieving such understanding can be difficult and challenging, particularly for large data sets with complex host genotype-by-pathogen strain interactions. This paper presents a biplot approach that facilitates visual analysis of host-by-pathogen data. A biplot displays both host genotypes and pathogen isolates in a single scatter plot; each genotype or isolate is displayed as a point defined by its scores on the first two principal components derived from subjecting genotype- or strain-centered data to singular value decomposition. From a biplot, clusters of host genotypes and clusters of pathogen strains can be simultaneously visualized. Moreover, the basis for genotype and strain classifications, i.e., interactions between individual genotypes and strains, can be visualized at the same time. A biplot based on genotype-centered data and that based on strain-centered data are appropriate for visual evaluation of susceptibility/resistance of genotypes and virulence/avirulence of strains, respectively. Biplot analysis of genotype-by-strain is illustrated with published response scores of 13 barley line groups to 8 net blotch isolate groups.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,475
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,092
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,117 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle