Abstract 34: Investigating PIN1 as a genetic modifier in Li-Fraumeni syndrome
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background: Li-Fraumeni syndrome (LFS) is characterized by marked clinical heterogeneity in site and age of cancer onset. The prolyl-isomerase, Pin1 (peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1), has been shown to serve a fundamental role in mutant TP53 oncogenic gain of function and the promotion of aggressive cancer phenotypes. We sought to determine whether alterations in PIN1 modify the phenotype of patients with germline mutations in TP53. Methods: The PIN1 promoter and coding regions were sequenced from peripheral blood lymphocyte samples of 107 individuals with Li-Fraumeni syndrome and documented TP53 mutations. The expression and activity levels of PIN1 were determined in paired patient-derived lymphoblastoid cell lines. Results: Multivariate analysis of PIN1 variants with TP53 mutation status and selected clinical parameters is in progress. A comprehensive summary of observed associations will be presented. Conclusions: Demonstration of a modifying effect of PIN1 on the cancer phenotype conferred by a germline TP53 mutation may aid in the management of patients with Li-Fraumeni syndrome, including the implementation of patient-specific modifications of surveillance strategies for pre-symptomatic tumor detection. Citation Format: Anita Villani, Ana Novokmet, David Malkin. Investigating PIN1 as a genetic modifier in Li-Fraumeni syndrome. [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference: Cancer Susceptibility and Cancer Susceptibility Syndromes; Jan 29-Feb 1, 2014; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2014;74(23 Suppl):Abstract nr 34. doi:10.1158/1538-7445.CANSUSC14-34
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».