Abstract 993: A high-throughput peptide array screen of H3K9 methyl effectors identifies UHRF1 as an exception to the “phospho/methyl switch.”
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Increasing evidence suggests that histone post-translational modifications (PTMs) function in combination to regulate the diverse activities associated with chromatin. However, the mechanisms through which multiple histone PTMs influence the association of effector proteins with chromatin is poorly understood. To address this problem, we recently developed a histone peptide array platform containing singly- and multiply-modified histone peptides to examine the binding of chromatin-associated proteins. Using these arrays, we surveyed protein domains that bound methylated H3K9, and uncovered a number of PTM “patterns” that influenced the association with this mark. Interestingly, while most H3K9 methyl binders were ejected by neighboring H3S10 phosphorylation (a PTM enriched in G2/M-phase chromatin), the tandem Tudor domain (TTD) of UHRF1 was insensitive to this known “phospho/methyl switch”. In agreement, structural and biophysical studies confirmed the insensitivity of the UHRF1 TTD to H3S10 phosphorylation. Furthermore, we found that UHRF1 remains bound to chromatin throughout the cell cycle in contrast to HP1, which is ejected from chromatin during mitosis. These results suggest an important role for this ubiquitin ligase during mitosis. Significantly, we further find that the TTD of UHRF1 regulates global DNA methylation, thus definitively linking H3K9me3 binding by UHRF1 to the maintenance of DNA methylation. Taken together, our data suggest that the regulation of DNA methylation by UHRF1 extends beyond S-phase and requires H3K9me3 recognition during mitosis. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 103rd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2012 Mar 31-Apr 4; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2012;72(8 Suppl):Abstract nr 993. doi:1538-7445.AM2012-993
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».