Genetic <scp>S</scp>tructure of <i><scp>C</scp>ochliobolus sativus </i><scp>P</scp>opulations <scp>S</scp>ampled from <scp>R</scp>oots and <scp>L</scp>eaves of <scp>B</scp>arley and <scp>W</scp>heat in <scp>N</scp>orth <scp>D</scp>akota
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Common root rot ( CRR ) and spot blotch, caused by Cochliobolus sativus (Ito and Kurib.) Drechsl. ex Dast., are important diseases of barley ( Hordeum vulgare L.) and wheat ( Triticum aestivum L.) worldwide. However, the population biology of C. sativus is still poorly understood. In this study, the genetic structure of three C. sativus populations, consisting of isolates sampled respectively from barley leaves ( BL ), barley roots ( BR ) and wheat roots ( WR ) in North Dakota, was analysed with amplified fragment length polymorphism ( AFLP ) markers. A total of 127 AFLP loci were generated among 208 C. sativus isolates analysed with three primer combinations. Gene diversity ( H = 0.277–0.335) were high in all three populations. Genetic variation among C. sativus individuals within population accounted for 74%, whereas 26% of the genetic variation was explained among populations. Genetic differentiation was high ( ØPT = 0.261, corrected = 0.39), whereas gene flow ( Nm ) ranged from 1.27 to 1.56 among the three populations analysed. The multilocus linkage disequilibrium ( LD ) ( = 0.076–0.117) was moderate in C sativus populations. Cluster analyses indicate that C. sativus populations differentiated according to the hosts (barley and wheat) and tissues (root and leaf) although generalists also exist in North Dakota. Crop breeding may benefit from combining genes for resistance against both specialists and generalists of C. sativus .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,006 | 0,043 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,007 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,010 | 0,004 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,007 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,004 |
| Communication savante | 0,002 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,007 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,006 | 0,007 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».