Rapid and sensitive separation of trace level protein digests using microfabricated devices coupled to a quadrupole - time-of-flight mass spectrometer
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
The application of microfabricated devices coupled to a quadrupole time-of-flight mass spectrometer (Qq-TOF-MS) is presented for the analysis of trace level digests of gel-isolated proteins. In order to enhance the sample loading for proteomics analyses, two different on-chip sample preconcentration techniques were evaluated. First, a sample stacking procedure that used polarity switching to remove the sample buffer prior to zone electrophoresis was easily integrated on the microfabricated devices. With the present chip design, this preconcentration technique provided up to 70 nL sample injection with sub-nM detection limits for most peptide standards. For applications requiring larger sample loading, a disposable adsorption preconcentrator using a C18 membrane is incorporated outside the chip. This preconcentration method yielded lower peptide recoveries than that obtainable with sample stacking, and provided a convenient means of injecting several microL of sample with detection limits of typically 2.5 nM for hydrophobic peptides. The analytical merits of both sample enrichment approaches are described for the identification of bands isolated from two-dimensional (2-D) gel separation of protein extracts from Haemophilus influenzae. Accurate molecular mass measurements (< 5 ppm) in peptide mapping experiments is obtained by introducing an internal standard via a post-separation channel. Rapid identification of trace level peptides is also demonstrated using on-line tandem mass spectrometry and database searching with peptide sequence tags.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle