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Enregistrement W2076538853 · doi:10.1897/06-513r.1

Interference of contaminated sediment extracts and environmental pollutants with retinoid signaling

2007· article· en· W2076538853 sur OpenAlexaff
Jiří Novák, Martin Beníšek, Jiřı́ Pachernı́k, Jaroslav Janošek, Tereza Šídlová, Hannu Kiviranta, Matti Verta, John P. Giesy, Luděk Bláha, Klára Hilscherová

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Toxicology and Chemistry · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinoids in leukemia and cellular processes
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAryl hydrocarbon receptorRetinoic acidRetinoidSignal transductionBioassayChemistryRetinoic acid receptorRetinoid X receptor betaReporter genePollutantBiologyEnvironmental chemistryBiochemistryGeneGene expressionEcologyTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Retinoids are known to regulate important processes such as differentiation, development, and embryogenesis. Some effects, such as malformations in frogs or changes in metabolism of birds, could be related to disruption of the retinoid signaling pathway by exposure to organic contaminants. A new reporter gene assay has been established for evaluation of the modulation of retinoid signaling by individual chemicals or environmental samples. The bioassay is based on the pluripotent embryonic carcinoma cell line P19 stably transfected with the firefly luciferase gene under the control of a retinoic acid-responsive element (clone P19/ A15). The cell line was used to characterize the effects of individual chemicals and sediments extracts on retinoid signaling pathways. The extracts of sediments from the River Kymi, Finland, which contained polychlorinated dioxins and furans and polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs), significantly increased the potency of all-trans retinoic acid (ATRA), while no effect was observed with the extract of the sediment from reference locality. Considerable part of the effect was caused by the labile fraction of the sediment extracts. Also, several individual PAHs potentiated the effect of ATRA; on the other hand, 2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin and several phthalates showed slightly inhibiting effect. These results suggest that PAHs could be able to modulate the retinoid signaling pathway and that they could be responsible for a part of the proretinoid activity observed in the sediment extracts. However, the effects of PAHs on the retinoic acid signaling pathways do not seem to be mediated directly by crosstalk with aryl hydrocarbon receptor.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,674

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,194
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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