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Enregistrement W2076724914 · doi:10.1158/1538-7445.am10-3510

Abstract 3510: The molecular docking-based design and biological evaluation of a novel series of bisintercalating DNA-binding bisanthrapyrazole compounds containing amine linkers

2010· article· en· W2076724914 sur OpenAlexaffabout
Xing Wu, Rui Zhang, Lynn J. Guziec, Frank S. Guziec, Jack C. Yalowich, Brian B. Hasinoff

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer therapeutics and mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTopoisomeraseDNAChemistryDocking (animal)BiochemistryEnzymeDoxorubicinStereochemistryBiologyMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Anticancer drugs that bind to DNA and inhibit DNA-processing enzymes represent an important class of anticancer drugs. In order to find stronger DNA binding and more potent cytotoxic compounds, a series of bisanthrapyrazole derivatives containing amine linkers were designed and evaluated by molecular docking techniques. Because the anthrapyrazoles are unable to be reductively activated like doxorubicin and other anthracyclines, they should lack the cardiotoxicity exhibited by this class of antitumor agent. The concentration dependent increase in DNA melting temperature was used to determine the strength of DNA binding and the bisintercalation potential of the newly synthesized analogs. These compounds were also assessed for their ability to inhibit: 1) the growth of the human erythroleukemic K562 cell line; 2) the decatenation activity of DNA topoisomerase IIα; 3) the relaxation activity of DNA topoisomerase I. Finally, the compounds were evaluated as topoisomerase IIα poisons by measuring the topoisomerase IIα-mediated double strand cleavage of DNA. All of the bisanthrapyrazoles inhibited K562 cell growth in the low to submicromolar concentration range and also strongly inhibited the decatenation activity of topoisomerase IIα. However, none of the bisanthrapyrazole compounds act as topoisomerase IIα poisons. In conclusion, a novel group of bisanthrapyrazole compounds were designed, synthesized, and biologically evaluated as potential anticancer agents. Support: CIHR, a Canada Research Chair in Drug Development to B.B.H., a National Institutes of Health grant CA090787 to J.C.Y. and the Dishman Foundation at Southwestern University. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 101st Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2010 Apr 17-21; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2010;70(8 Suppl):Abstract nr 3510.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,186
Tête enseignante GPT0,427
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
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