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Enregistrement W2076927607 · doi:10.1021/jf062927+

Polymerase Chain Reaction Assay for the Detection of<i> Kudoa paniformis</i> and <i>Kudoa thyrsites</i> in Pacific Hake (<i>Merluccius productus</i>)

2007· article· en· W2076927607 sur OpenAlexaff
Guang Tao Meng, Eunice C.Y. Li‐Chan

Notice bibliographique

RevueJournal of Agricultural and Food Chemistry · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMyxozoan Parasites in Aquatic Species
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesOregon State University
Mots-clésHakeMerlucciusPolymerase chain reactionBiologyRibosomal DNAMicrobiologySporeZoologyFisheryGeneticsFish <Actinopterygii>PhylogeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Myoliquefaction of Pacific hake has been attributed to proteolytic action associated with parasitic infection. Among the two infecting species of Kudoa, Kudoa paniformis and Kudoa thyrsites, the former is reported to be more virulent for the "soft flesh" phenomenon in Pacific hake. The objective of this research was to develop a sensitive and specific polymerase chain reaction (PCR) assay to detect infection of hake by K. paniformis. Primers based on specific regions ( approximately 1562 bp) of the small subunit ribosomal DNA of K. paniformis successfully amplified the target DNA segments from both spore and muscle extracted DNA templates. DNA sequencing confirmed the veracity of this method to distinguish parasitic infection by K. paniformis versus K. thyrsites. The established PCR method was applied to investigate Kudoa infection in 44 Pacific hake samples using DNA extracted from muscle and/or spores, and the results were compared to infection evaluated by microscopic examination of extracted spores.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,380

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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