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Enregistrement W2077579039 · doi:10.1080/07060661.2014.966151

Pathogenicity of <i>Diaporthe</i> spp. isolates recovered from soybean ( <i>Glycine max</i> ) seeds in Paraguay

2014· article· en· W2077579039 sur OpenAlexvenueno aff
Alemu Mengistu, Lisa A. Castlebury, W. Morel, Jeffrey D. Ray, James R. Smith

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAgricultural Research ServiceU.S. Department of Agriculture
Mots-clésBiologyConidiumPhomopsisSporeCultivarHorticultureBotanyPathogenicityFungi imperfectiVeterinary medicineMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Phomopsis seed decay (PSD) caused by Diaporthe longicolla has been documented as part of a soybean (Glycine max) fungal disease complex that affects the quality of soybean seed. Soybean-producing countries that have not yet documented the presence of PSD impose soybean seed import restrictions to protect their soybean production. The purpose of this study was to determine the frequency of occurrence of Diaporthe spp. in Paraguay. In 2006, 16 isolates of Diaporthe were recovered for the first time from soybean seed in San Alberto, Paraguay in the south-eastern section of the country. The 16 isolates were used to inoculate mature pods harvested from greenhouse grown PSD-susceptible soybean cultivar ‘Maverick’. Among the16 isolates, six isolates (TN 214, TN 218, TN 224, TN 226, TN 227 and TN 229) caused infection on both pods and seeds within pods. Two groups of isolates were identified based on conidial types: isolates that produced only α conidia and isolates that produced both α and β conidia. The percentage of β conidia ranged from 0 to 95% for all the isolates except for TN 218, TN-222 and TN 223, which only produced α conidia. These results indicate that considerable variability exists in pathogenicity and composition of α and β spores among the 16 Diaporthe spp. isolates recovered from soybean seeds in Paraguay. In addition, these isolates may cause seed quality losses and may spread undetected to soybean production fields in Paraguay and around the world. Although the Diaporthe spp. isolates had three distinct ITS sequence types, none of the three probable species could be identified using currently available information. It is possible that these isolates represent previously unrecognized species, in addition to D. longicolla or D. phaseolorum, but additional data will be required to determine if this is the case.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil0,045

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,188
Écart entre enseignants0,181 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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