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Enregistrement W2077629365 · doi:10.1074/jbc.m011710200

Molecular Characterization of Peripherin-2 and Rom-1 Mutants Responsible for Digenic Retinitis Pigmentosa

2001· article· en· W2077629365 sur OpenAlexaff
Christopher Loewen, Orson L. Moritz, Robert S. Molday

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Tyrosine Phosphatases
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Eye Institute
Mots-clésRetinitis pigmentosaPeripherinMutantGeneticsBiologyMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Peripherin-2 and Rom-1 are homologous tetraspanning membrane proteins that assemble into noncovalent tetramers and higher order disulfide-linked oligomers implicated in photoreceptor disc morphogenesis. Individuals who coinherit a L185P peripherin-2 mutation and a null or G113E rom-1 mutation are afflicted with retinitis pigmentosa, whereas individuals who inherit only one defective gene are normal. We examined the expression, subunit assembly, and disulfide-mediated oligomerization of L185P and L185A peripherin-2 and L188P Rom-1 by velocity sedimentation, co-immunoprecipitation, and cross-linking. These mutants formed noncovalent dimers under disulfide-reducing conditions but failed to assemble into core tetramers. Under nonreducing conditions, L185P dimers formed disulfide-linked tetramers but not higher order oligomers. L185P coassembled with wild-type peripherin-2 and Rom-1 to form tetramers and higher order disulfide-linked oligomers characteristic of the wild-type proteins. The G113E Rom-1 mutant expressed 20-fold lower than wild-type Rom-1, indicating that it behaves mechanistically as a null allele. We conclude that Leu(185) of peripherin-2 (Leu(188) of Rom-1) is critical for tetramer but not dimer formation and that the core tetramer has 2-fold symmetry. Peripherin-2-containing tetramers are required for higher order disulfide-linked oligomer formation. The level of these oligomers is critical for stable photoreceptor disc formation and the digenic retinitis pigmentosa disease phenotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations75
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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