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Enregistrement W2077749987 · doi:10.1038/ncomms6987

BCL11A is a triple-negative breast cancer gene with critical functions in stem and progenitor cells

2015· article· en· W2077749987 sur OpenAlexaff
Walid T. Khaled, Song Choon Lee, Julia Stingl, Xiongfeng Chen, H. Raza Ali, Oscar M. Rueda, Fazal Hadi, Juexuan Wang, Yong Yu, Suet‐Feung Chin, Mike Stratton, Andy Futreal, Nancy A. Jenkins, Samuel Aparício, Neal G. Copeland, Christine J. Watson, Carlos Caldas, Pentao Liu

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilHutchison Whampoa LimitedMedical Research CouncilRussian Science FoundationKing's College LondonNational Institute for Health and Care ResearchUniversity of CambridgeCancer Research UKWellcome Trust
Mots-clésTriple-negative breast cancerCancer researchGene knockdownBreast cancerProgenitor cellStem cellBiologyCancer stem cellCancerGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Triple-negative breast cancer (TNBC) has poor prognostic outcome compared with other types of breast cancer. The molecular and cellular mechanisms underlying TNBC pathology are not fully understood. Here, we report that the transcription factor BCL11A is overexpressed in TNBC including basal-like breast cancer (BLBC) and that its genomic locus is amplified in up to 38% of BLBC tumours. Exogenous BCL11A overexpression promotes tumour formation, whereas its knockdown in TNBC cell lines suppresses their tumourigenic potential in xenograft models. In the DMBA-induced tumour model, Bcl11a deletion substantially decreases tumour formation, even in p53-null cells and inactivation of Bcl11a in established tumours causes their regression. At the cellular level, Bcl11a deletion causes a reduction in the number of mammary epithelial stem and progenitor cells. Thus, BCL11A has an important role in TNBC and normal mammary epithelial cells. This study highlights the importance of further investigation of BCL11A in TNBC-targeted therapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,343
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations161
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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