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Enregistrement W2078421460 · doi:10.1121/1.4783856

Current applications of ultrasonic resonators to biomolecular studies.

2009· article· en· W2078421460 sur OpenAlexaff
Tigran V. Chalikian

Notice bibliographique

RevueThe Journal of the Acoustical Society of America · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA and Nucleic Acid Chemistry
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCompressibilityResonatorNucleic acidIntermolecular forceMaterials scienceFolding (DSP implementation)Ultrasonic sensorChemical physicsChemistryThermodynamicsAcousticsPhysicsOptoelectronicsMolecule

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The most versatile family of instruments providing the highest precision of acoustic measurements in the lowest sample volumes utilizes the method of fixed-path interferometer. The speed of sound in a medium is a simple function of its density and compressibility. Both parameters are determined by and, therefore, reflect the entire spectrum of intra- and intermolecular interactions within the system. In addition, compressibility probes the pressure response of these interactions. Current resonator-based instruments provide reliable measurements in diluted solutions of biological compounds with solute concentrations on the order of 1 mg/mL and solution volumes of 1 mL. They require less than 1 mg of sample, a range acceptable for the majority of biochemical and biophysical investigations. Ultrasonic velocimetric measurements have been employed to study a range of biologically relevant reactions, including the folding/unfolding transitions of proteins and helix-to-coil transitions of nucleic acids, as well as drug-DNA, ligand-protein, protein-protein, and protein-DNA association events. The limiting factor in such investigations is the need to rationalize the measured properties (volume, compressibility, and their derivatives) in terms of microscopic events, such as solute-solvent interactions. This presentation reviews biomolecular applications of acoustic measurements and discusses the development of approaches for microscopic interpretation of macroscopic volumetric observables.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,038

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0110,008

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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